TCGA嗜铬细胞瘤和副神经节瘤数据集
TCGA嗜铬细胞瘤和副神经节瘤数据集公开提供表格数据，围绕副神经节瘤多组学相关病例、标注或临床/组学信息，适合用于分类、算法训练、外部验证、表型分析和疾病机制探索。
基本信息
资源简介
TCGA嗜铬细胞瘤和副神经节瘤数据集
【一句话概览】
对嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCC/PGL）的综合分子特征分析显示，这类罕见肿瘤由影响多个基因和通路的多样改变驱动，致病性种系突变见于八个易感基因。研究确定CSDE1为体细胞突变驱动基因，补充了已知的HRAS、RET、EPAS1和NF1四个驱动基因，并发现涉及MAML3、BRAF、NGFR和NF1的融合基因。整合分析将其分为激酶信号、假缺氧、Wnt改变和皮质混合四个分子亚型，MAML3融合基因与转移相关，为精准医疗提供了基础（来源 gdc.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Comprehensive Molecular Characterization of Pheochromocytoma and Paraganglioma》。
【数据内容】
源站原始描述：We report a comprehensive molecular characterization of pheochromocytomas and paragangliomas (PCCs/PGLs), a rare tumor type. Multi-platform integration revealed that PCCs/PGLs are driven by diverse alterations affecting multiple genes and pathways. Pathogenic germline mutations occurred in eight PCC/PGL susceptibility genes. We identified CSDE1 as a somatically mutated driver gene, complementing four known drivers (HRAS, RET, EPAS1, and NF1). We also discovered fusion genes in PCCs/PGLs, involvi…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：我们报告了对嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCCs/PGLs）这种罕见肿瘤类型的全面分子特征描述。多平台整合分析揭示，PCCs/PGLs由影响多个基因和通路的多种改变驱动。致病性生殖系突变发生在八个PCC/PGL易感基因中。我们确定了CSDE1作为体细胞突变的驱动基因，补充了四个已知的驱动基因（HRAS、RET、EPAS1和NF1）。我们还发现了PCCs/PGLs中的融合基因，涉及MAML3、BRAF、NGFR和NF1。综合分析将PCCs/PGLs分为四个分子定义的组别：激酶信号亚型、假缺氧亚型、由MAML3和CSDE1驱动的Wnt改变亚型，以及皮质混合亚型。转移性PCCs/PGLs的相关因素包括MAML3融合基因。这种整合的分子特征描述为发展PCC/PGL精准医疗提供了全面的基础。
【主题与分类】
主题标签：Pheochromocytoma、Paraganglioma、TCGA、PCPG、Cancer Genomics、Molecular Characterization、SNP、Copy Number Variation、RNA Expression、miRNA。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/pcpg_2017
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/pcpg_2017
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
TCGA嗜铬细胞瘤和副神经节瘤数据集是与副神经节瘤多组学相关的公开数据集，包含表格数据，可用于分类、分型、诊断或预后研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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