基本信息

模态

蛋白质

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-12

资源简介

胆脂瘤大规模蛋白质组学数据集

Large scale proteomics of cholesteatoma 是一个公开的蛋白质组学数据集，主题聚焦于耳鼻咽喉疾病中的胆脂瘤。该数据集来源于 ebi.ac.uk，属于耳鼻咽喉疾病 / 胆脂瘤分类下的公开数据资源。其核心内容围绕胆脂瘤的大规模蛋白质组学展开，由 Johan Palmfeldt 提交，并在 PRIDE 数据库中登记，项目编号为 PXD000457。该数据集为耳鼻咽喉疾病领域的研究人员提供了一个可访问的蛋白质组学数据资源，主题标签涵盖耳鼻咽喉疾病、胆脂瘤、蛋白质组学、PRIDE 以及 PXD000457。整体而言，该数据集旨在支持对胆脂瘤相关蛋白质表达和组成的大规模分析，属于耳鼻咽喉疾病领域公开数据集的一部分，主题涵盖耳鼻咽喉疾病。

【数据集背景】

胆脂瘤是耳鼻咽喉疾病中的一种病变类型，其病理机制和分子特征受到研究关注。该数据集以“Large scale proteomics of cholesteatoma”为英文名称，直接指向胆脂瘤的大规模蛋白质组学研究。数据集的来源站为 ebi.ac.uk，源站描述中标注了作者 Johan Palmfeldt，并以数据集形式发布，链接指向 PRIDE 归档项目 PXD000457。该数据集在本站分类中归入耳鼻咽喉疾病 / 胆脂瘤，属于该领域公开数据集，主题涵盖耳鼻咽喉疾病。其背景体现了将蛋白质组学技术应用于胆脂瘤研究的思路，旨在通过大规模蛋白质检测与分析，为理解胆脂瘤的分子层面特征提供数据基础。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括耳鼻咽喉疾病、胆脂瘤、蛋白质组学、PRIDE、PXD000457。从名称和标签可以看出，其内容属于蛋白质组学数据，围绕胆脂瘤这一耳鼻咽喉疾病展开。数据集为公开数据集，主题涵盖耳鼻咽喉疾病。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数量、表达量矩阵、差异蛋白列表等详细数据内容，源站未提供。因此，无法进一步描述其数据表结构、字段组成或具体分子列表。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，源站描述中注明作者为 Johan Palmfeldt，数据集名称为 Large scale proteomics of cholesteatoma，并提供了 PRIDE 归档链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000457。项目编号为 PXD000457。该数据集通过 PRIDE 数据库公开，属于蛋白质组学数据归档的一部分。关于样本采集地点、采集时间、实验流程、仪器型号、色谱条件、质谱参数等具体采集信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于耳鼻咽喉疾病特别是胆脂瘤相关的蛋白质组学研究场景。研究人员可将其用于胆脂瘤蛋白质表达谱分析、分子机制探索、生物标志物发现等方向。由于主题标签包含蛋白质组学和 PRIDE，该数据集也可用于蛋白质组学方法学比较、公共数据再利用以及跨数据集整合分析。本站分类为耳鼻咽喉疾病 / 胆脂瘤，因此适合耳鼻咽喉科、头颈外科、病理学以及蛋白质组学相关领域的研究人员使用。具体适用场景的详细说明，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站提供的 PRIDE 归档链接访问，项目编号为 PXD000457。用户可根据 PRIDE 数据库的常规使用方式获取数据。关于数据下载格式、文件类型、分析工具、处理流程、参数设置等具体使用方法，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集，来源于 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、技术重复、样本量大小、统计功效等质量相关信息，源站未提供。其限制方面，由于源站未提供详细实验设计和数据特征，用户在使用时需自行评估数据适用性。该数据集的主题涵盖耳鼻咽喉疾病，分类为耳鼻咽喉疾病 / 胆脂瘤，可能受限于特定疾病类型和蛋白质组学技术平台。具体质量与限制说明，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为：Johan Palmfeldt, Large scale proteomics of cholesteatoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000457。关于该数据集的许可协议、使用条款、再分发条件等，源站未提供。用户在引用时应遵循源站描述中的引用格式，并访问 PRIDE 项目页面获取最新许可信息。

原始链接

https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000457

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000457

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Johan Palmfeldt, Large scale proteomics of cholesteatoma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000457

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别