PXD013196：PTENa/b通过WDR5-H3K4me3轴矛盾性促进肿瘤发生

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD013196

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PTEN是一种被广泛研究的抑癌基因，它至少有两种较长的翻译变体，即PTENα和PTENβ。然而，内源性PTENα/β在肿瘤发生中的调控机制和确切作用仍很大程度上未知。本研究表明，USP9X和FBXW11分别通过去泛素化和泛素化选择性调控PTENα/β而非PTEN蛋白的稳定性。USP9X促进由PTENα/β介导的肿瘤发生，而FBXW11则抑制这一过程。与当前将PTEN视为抑癌基因的范式相反，PTENα/β以不依赖磷酸酶的方式促进癌细胞的肿瘤发生。在机制上，定位于细胞核的PTENα/β以与H3K4呈递蛋白WDR5相似的方式调控NOTCH3等促肿瘤基因的表达。此外，PTENα/β而非PTEN直接与WDR5相互作用，促进H3K4三甲基化并维持促肿瘤特征。综上所述，我们的结果表明，PTENα/β在癌发生中是一把双刃剑，提示有必要重新解读PTEN基因在癌发生中的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。