细胞因子谱数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.71663/curtain.e3kv-zy19

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：富亮氨酸重复激酶2（LRRK2）基因的激活突变是帕金森病（PD）最常见的遗传病因。除在神经退行性变中的作用外，LRRK2遗传变异还与自身免疫性疾病相关。本研究探讨了LRRK2突变在PD外周炎症中的潜在作用。方法：采用邻近延伸分析（PEAs），利用来自西班牙一个携带两种最常见LRRK2突变的大型LRRK2临床队列的血浆样本，检测了92种公认炎症标志物的循环水平。该队列包括G2019S LRRK2驱动的帕金森病患者（L2PD）（n=37）、G2019S LRRK2非显性携带者（L2NMCs）（n=27）、R1441G L2PD患者（n=14）、R1441G L2NMCs（n=11）、特发性PD病例（iPD）（n=40）和健康对照（n=45）（总计n=174）。

结果：采用性别和年龄校正的线性模型，并通过置换检验确定统计学显著性，在表达差异>30%（log2倍数变化>|0.38|）且错误发现率（FDR）多重检验校正后P<0.05的条件下，我们观察到表现为PD的及未表现的G2019S和R1441G携带者具有特定的炎症特征。具体而言，与对照组相比，G2019S L2PD显示EN-RAGE（炎症小体活化的上游调节因子）上调，同时HGF、CXCL9和CCL25也上调。此外，R1441G L2PD显示SIRT2和STAMBP上调，二者均为已知的炎症小体抑制因子。有趣的是，对G2019S和R1441G无症状携带者的分别分析显示其炎症水平高于对照组，例如CCL20（自身免疫性慢性疾病的标志物），其与G2019S L2NMCs中较高的内源性LRRK2激酶活性相关（通过pSer106 RAB12读出评估）。最后，iPD病例显示IL-6显著上调，与此前其他PD研究报道一致。结论：我们的研究结果表明，LRRK2致病性变异与外周炎症相关

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。