前纤毛输卵管上皮细胞易发高级别浆液性卵巢癌

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Adcb12bcda4cb321ea6d9e20c3a160d96ffc778eac5bda8efda6eaaf5fc93b2ab

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数据说明

子宫（输卵管）管的远端区域通常与高级别浆液性癌（HGSC）相关，后者是卵巢或宫外癌中最主要且最具侵袭性的形式。成年输卵管上皮（TE）的特定细胞状态和谱系动态仍未被充分了解，这阻碍了确定HGSC起源细胞的努力。在此，我们报告了对小鼠输卵管细胞类型和状态的全面普查。我们显示，表达干/祖细胞标志物Slc1a3的远端TE细胞可分化为分泌细胞（Ovgp1+）和纤毛细胞（Fam183b+）。Trp53和Rb1的失活——其通路在HGSC中常发生改变——导致靶向的Slc1a3+细胞通过凋亡被消除，从而阻止其恶性转化。相反，前纤毛细胞（Krt5+、Prom1+、Trp73+）保持易癌变性，并产生浆液性输卵管上皮内癌和明显的HGSC。这些发现确定了过渡性前纤毛细胞……，单细胞RNA测序文库制备 对于TE单细胞表达和转录组分析，我们从C57BL6成年动情期雌性小鼠中分离了TE。

在3项独立实验中，共采集了62条输卵管。每条输卵管置于含100 IU ml-1青霉素和100 µg ml-1链霉素（Corning，30-002-Cl）的无菌PBS中，并分为远端和近端区域。同一区域的组织在40 µl相同PBS溶液的液滴中合并，纵向剖开，并用25G针头切碎成1.5-2.5 mm的小块。切碎的组织借助无菌宽口200 µl移液器吸头转移至含1.2 ml A-mTE-D1（300 IU ml-1 IV型胶原酶与100 IU ml-1透明质酸酶混合；Stem Cell Technologies，07912，溶于DMEM Ham’s F12，Hyclone，SH30023.FS）的1.8 ml冻存管中。组织在松盖条件下于37°C、5% CO2培养箱中孵育1小时。孵育期间，试管取出4次，组织

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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