小鼠少突胶质前体细胞全生命周期转录谱

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/886ff63c-af9e-4fcc-9c51-64a92cb6fd48

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

少突胶质前体细胞（OPCs）是中枢神经系统（CNS）中高度动态、广泛分布的胶质细胞，负责在发育过程中生成髓鞘化的少突胶质细胞。然而，随着年龄增长，OPC的增殖和分化速率显著下降，这可能损害稳态、髓鞘再生以及学习过程中的适应性髓鞘形成。为了确定衰老如何影响OPCs，我们构建了一种新的转基因小鼠品系，该品系在Matrilin-4内源性启动子/增强子调控下表达膜锚定的EGFP（Matn4-mEGFP），使得OPCs能够与血管周细胞和壁细胞分离纯化。从Matn4-mEGFP小鼠大脑皮层中分离的OPCs进行了单细胞RNA测序，从而在从静息态到增殖和分化的关键转变过程中，以更高的分辨率揭示了整个生命周期中的转录变化。该Matn4-mEGFP小鼠品系以及跨年龄皮层OPCs的单细胞mRNA数据集，为帮助界定在各种生理和病理背景下指导其行为的分子变化提供了宝贵的参考。疾病：正常。组织：大脑皮层。

检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。