单核RNA测序揭示成年小鼠脊髓胆碱能神经元类型的意外多样性

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/101d14fc-754d-42ad-883d-d810b00b06e3

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在脊椎动物中，运动控制依赖于脊髓中的胆碱能神经元，过去一百年来这些神经元已被广泛研究，但它们在成体中完整的异质性及其不同的功能角色仍有待明确。在此，我们开发了一种靶向单核RNA测序方法，并利用它鉴定出一系列胆碱能中间神经元、内脏运动神经元和骨骼运动神经元。我们的数据揭示了用于区分这些胆碱能神经元类别及其丰富多样性的标记物。具体而言，提供自主控制的内脏运动神经元可分为十多个转录组类别，并在脊髓中具有解剖学上受限的定位。骨骼运动神经元的复杂性也反映在我们的分析中，α、γ以及第三种亚型——可能对应于难以捉摸的β运动神经元——被清晰区分开来。综合来看，我们的数据为这一重要的神经元群体提供了全面的转录组描述，这些神经元控制着生理和运动的许多方面，并构成了使人衰弱的退行性疾病的细胞基础。疾病：正常。

组织：颈段脊髓、腰段脊髓、胸段脊髓。检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。