人类发育中脊髓单细胞转录组图谱揭示保守遗传程序及人类特异性特征

数据集获取

源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/847fafc3-41a1-4a0d-9461-0328c88e9b13

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脊髓接收来自外周感觉神经元的输入，并通过调节支配肌肉的运动神经元来控制运动输出。这些功能由神经回路执行，这些回路包含分子上不同的神经元亚型，它们以特征性的时空排列从胚胎神经管中的祖细胞产生。为了深入了解发育中的人类神经管中细胞的多样性和复杂性，我们使用单细胞mRNA测序技术，对四个处于卡内基分期（CS）CS12、CS14、CS17和CS19，即孕周4-7周的人类胚胎的颈段和胸段进行了分析。对来自神经管和背根神经节的祖细胞和神经元群体的分析，识别出了数十种不同的细胞类型，并促进了对特定神经元亚型分化路径的重建。与小鼠的比较揭示了哺乳动物神经管发育的总体相似性，同时突显了一些人类特有的特征。这些数据提供了人类神经管中基因表达和细胞类型身份的一个目录，将支持未来对感觉和运动控制系统的研究。疾病：正常。组织：神经管。

检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。