PXD000655:脑脊液蛋白质组图谱:人脑脊液 LC-MS/MS,第5部分

实验使用 21 名神经学健康供体混合的 1.6 mL 脑脊液,经 MARS Hu-14 柱分离为结合与耗竭两部分,本数据集为结合部分

pride
2014-08-04 更新
浏览 8
蛋白质分类Cerebrospinal fluid. homo sapiensLc-ms/ms
PXD000655: CSF proteome mapping: Human cerebrospinal fluid LC-MS/MS, Part 5

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2014-08-04

资源简介

PXD000655:脑脊液蛋白质组图谱:人脑脊液 LC-MS/MS,第5部分

该数据集来自 EBI,属于神经系统疾病 / 其他分类,英文名为 PXD000655: CSF proteome mapping: Human cerebrospinal fluid LC-MS/MS, Part 5。实验使用 21 名神经学健康供体混合的 1.6 mL 脑脊液,经 MARS Hu-14 柱分离为结合与耗竭两部分,本数据集为结合部分。样本经溶液内胰蛋白酶消化,肽段通过混合模式反相阴离子交换(MM(RP-AX))在 Promix MP 柱上分为 10 个组分,每个组分在 Orbitrap Velos Pro 质谱仪上单独进行 LC-MS/MS 分析。数据经 SearchGui 搜索、PeptideShaker 汇总并导出。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):将来自 21 名神经学健康供体混合池的 1.6 mL 脑脊液,使用 MARS Hu-14 柱分离为结合部分和耗竭部分。本实验代表结合部分。样本经溶液内胰蛋白酶消化,肽段通过混合模式反相阴离子交换(MM(RP-AX))使用 Promix MP 柱分级为 10 个组分。每个组分在 Orbitrap Velos Pro 质谱仪上通过 LC-MS/MS 单独分析。所得数据使用 SearchGui 搜索,在 PeptideShaker 中汇总,并导出至 CSF-PR。

【主题与分类】

主题标签:Cerebrospinal fluid. homo sapiens、Lc-ms/ms。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000655

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000655

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

将来自21名神经系统健康供者混合样本的1.6 mL脑脊液,使用MARS Hu-14柱分离为结合组分和耗竭组分。本实验代表结合组分。样本经溶液内胰蛋白酶消化后,肽段通过混合模式反相阴离子交换(MM(RP-AX))使用Promix MP柱分级为10个组分。每个组分分别在Orbitrap Velos Pro质谱仪上通过LC-MS/MS进行分析。所得数据使用SearchGui进行检索,在PeptideShaker中汇总,并导出至CSF-PR。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。