PXD001282：Ogden成纤维细胞N端COFRADIc差异分析

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001282

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

X连锁致死性 Ogden 综合征是首个报道的与 N端乙酰转移酶基因突变相关的人类遗传病。受累男性携带编码 hNaa10 的基因中的 Ser37Pro 突变，hNaa10 是 NatA 的催化亚基，而 NatA 是人类主要的 NAT。为了理解 hNaa10 Ser37Pro 的有害影响，我们进行了结构、分子和细胞研究。对人类 NatA 及其 Ser37Pro 突变体的结构模型和分子动力学模拟提示，在参与催化的区域以及 hNaa10 与辅助亚基 hNaa15 的界面处存在差异。与此一致，生化数据表明 hNaa10 Ser37Pro 的催化能力降低，且 NatA 复合物形成受损。患者来源的 Naa10 突变细胞显示，与野生型 Naa10 细胞相比，对一部分 NatA/NatE 型底物的 Nt-乙酰化降低。Ogden 综合征成纤维细胞还表现出异常的细胞增殖和迁移能力，这可能分别与 Retinoblastoma 和 MYLK 通路受到扰动有关。差异 N端联合分级对角色谱（COFRADIC）曾用于定量体内蛋白质 Nt-乙酰化的程度并确定其模式，此处用于研究源自一名受累 Ogden 男性（携带 Naa10 S37P 突变）的患者细胞是否在全蛋白质组水平上表现出蛋白质 Nt-乙酰化水平的改变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。