rapgef1b在神经嵴特化与体节前中胚层模式建成中的发育功能

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE283261

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数据说明

Rapgef1是一种细胞命运决定因子和多种信号传导事件的效应分子，对哺乳动物胚胎发育至关重要。本研究以斑马鱼为模型，探讨了rapgef1的发育作用。我们发现rapgef1为母源表达，其两个旁系同源基因rapgef1a和rapgef1b的可变剪接异构体呈现发育阶段和组织特异性表达模式。基于CRISPR-Cas9和吗啉代寡核苷酸靶向rapgef1b可导致胚胎脑和体节发育缺陷。rapgef1b吗啉代敲低胚胎显示颅神经嵴谱系决定因子表达改变。对敲低胚胎的比较转录组分析和表达变化分析，为rapgef1b在前体节中胚层和体节发生中的发育功能提供了新的见解。在早期胚胎有丝分裂过程中，敲低胚胎表现出有丝分裂缺陷，如纺锤体极弥散和染色体排列异常。我们的结果表明，rapgef1b是胚胎发育过程中正常有丝分裂、颅神经嵴特化、体节发生和肌发生所必需的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。