MBD5作为m5C RNA阅读器调控发育与功能中的组蛋白泛素化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222803

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数据说明

含甲基化CpG结合域（MBD）的蛋白是表观遗传信息的阅读器。其创始成员MeCP2在Rett综合征中发生突变，能与甲基化的CpG DNA结合。MBD5是进化上保守的MBD家族成员，与癫痫、自闭症谱系障碍（ASD）及早发性痴呆相关。MBD5的作用机制尚不清楚。在此，我们报道mbd5在斑马鱼中调控胚胎发育、红细胞分化、铁代谢及行为。MBD5通过结合5-甲基胞嘧啶（m5C）修饰的mRNA，与多梳抑制性去泛素化酶（PR-DUB）复合物的组分Additional Sex Combs Like 1（ASXL1）相互作用并使其稳定，促进去除组蛋白H2A上的抑制性单泛素化标记（H2A-K119Ub），从而促进红细胞分化基因（如hbae3）、铁调控基因（如fth1）及ASD相关基因（如gabbr2）的表达激活，因此MBD5对这些基因的激活至关重要。总之，这些发现揭示了MBD5作为一种m5C RNA阅读器，在体内将RNA甲基化与组蛋白修饰联系起来。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。