基于质谱的野生型与DYT-TOR1A肌张力障碍小鼠模型胚胎成纤维细胞在基础及应激状态下的蛋白质组学数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.17632/58wghvz7sz

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 32.9 MB。

数据说明

在此，我们展示了来自三种野生型和三种DYT-TOR1A小鼠胚胎成纤维细胞（MEF）细胞系的亚细胞区室特异性定量蛋白质组学数据，这些数据包括基础状态以及经毒胡萝卜素处理后的情况。原代MEF培养物源自野生型和一种杂合DYT-TOR1A肌张力障碍小鼠模型。随后，这些MEF培养物分别用1 µM毒胡萝卜素或二甲基亚砜溶剂处理六小时。处理后，细胞被分级分离为细胞核和细胞质组分，然后进行液相色谱-串联质谱为基础的蛋白质组学分析。蛋白质组学分析在所有样本中鉴定出65,056个独特肽段和4801个独特蛋白质。在本数据集中，我们提供了每个样本的原始未处理质谱峰、每个样本中每个鉴定肽段的原始肽段计数、每个样本中每个鉴定蛋白质的原始蛋白质计数，以及每个样本中每个鉴定蛋白质的归一化蛋白质计数。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。