阿尔茨海默病人前额叶皮层单细胞蛋白质组分析数据集

该数据集来自 omicsdi.org,收录了人类前额叶皮层(Brodmann area 9)中分离的 2000 多个单细胞,样本来自三名女性个体:两名处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者(Braak III 和 Braak VI)以及一名非 AD 对照受试者(Braak 0)

omicsdi
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蛋白质分类Single-cellHumanAlzheimer's disease
Single cell proteomic analysis of human prefrontal cortex in Alzheimer's Disease

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

阿尔茨海默病人前额叶皮层单细胞蛋白质组分析数据集

该数据集聚焦于阿尔茨海默病在人类前额叶皮层中的单细胞蛋白质组特征,来源于公开组学资源平台 omicsdi.org,归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病方向。数据集的核心价值在于以单细胞分辨率观察前额叶皮层这一与高级认知功能密切相关的脑区,在阿尔茨海默病不同进展阶段中的细胞层面变化。样本覆盖三名女性个体,其中包括两名处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者,分别对应 Braak III 和 Braak VI 阶段,以及一名非阿尔茨海默病对照受试者,对应 Braak 0 阶段。数据集共包含从人类前额叶皮层 Brodmann area 9 区域分离的 2000 多个单细胞,主题标签涵盖单细胞、人类与阿尔茨海默病,适合用于探索疾病进展相关的细胞异质性与蛋白质表达差异。

【数据集背景】

阿尔茨海默病是一种以认知功能进行性衰退为特征的神经系统疾病,其病理进程常借助 Braak 分期进行描述。前额叶皮层,尤其是 Brodmann area 9,参与执行功能、工作记忆等高级认知活动,在阿尔茨海默病研究中具有重要价值。传统批量组织分析难以揭示细胞类型和状态之间的差异,而单细胞层面的蛋白质组分析有助于在更精细的尺度上理解疾病进展中的细胞变化。该数据集正是在这一背景下,提供了来自人类前额叶皮层的单细胞蛋白质组数据,覆盖不同 Braak 阶段的阿尔茨海默病患者与非患病对照,为研究疾病进展相关的细胞特征提供了资源。

【数据内容】

该数据集收录了超过 2000 个从人类前额叶皮层 Brodmann area 9 分离的单细胞。样本来自三名女性个体,其中两名阿尔茨海默病患者分别处于不同的疾病进展阶段,即 Braak III 和 Braak VI;另一名非阿尔茨海默病对照受试者处于 Braak 0 阶段。数据集的主题标签包括 Single-cell、Human 和 Alzheimer's disease,表明其围绕人类单细胞与阿尔茨海默病主题组织。源站描述未提供更详细的细胞类型组成、蛋白质检测数量、定量指标或数据文件结构等信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,样本为从人类前额叶皮层 Brodmann area 9 分离的单细胞,供体为三名女性个体,包括两名处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者和一名非阿尔茨海默病对照受试者。关于具体的样本采集流程、伦理审批信息、组织处理方式、单细胞分离技术、蛋白质组检测平台及试剂来源等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于阿尔茨海默病相关的单细胞蛋白质组研究,尤其适合关注人类前额叶皮层在疾病不同进展阶段中细胞层面变化的研究方向。由于样本涵盖 Braak III、Braak VI 和 Braak 0 三种状态,可用于比较阿尔茨海默病进展阶段与非患病对照之间的单细胞蛋白质组特征。主题标签中的单细胞、人类和阿尔茨海默病也提示其适用于单细胞组学、神经退行性疾病以及前额叶皮层相关研究。关于具体的分析应用、统计方法或验证用途,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析流程或软件工具建议。使用者如需使用该数据集,应参考 omicsdi.org 上该数据集的原始页面获取进一步说明。

【质量与限制】

该数据集样本量有限,仅来自三名女性个体,其中两名阿尔茨海默病患者分别处于 Braak III 和 Braak VI 阶段,另一名对照处于 Braak 0 阶段。由于样本仅涉及女性,且个体数量较少,在推广到更广泛人群时需谨慎。关于数据质量评估、批次效应、技术重复、覆盖度、蛋白质检出限等具体质量指标,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款信息。使用者应访问 omicsdi.org 上该数据集的原始页面,以获取准确的引用要求和许可说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD063590

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在此提供了一个数据集,包含来自三位女性个体的人类前额叶皮层(布罗德曼9区)的2000多个分离单细胞——两位处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者(Braak III期和VI期)以及一位非阿尔茨海默病对照受试者(Braak 0期)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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