衰老与阿尔茨海默脑中的RNA编辑_Yiyi Ma等
衰老与阿尔茨海默脑中的RNA编辑:转录组与蛋白质组视角 关于本数据来源的研究信息,请参见 宗教秩序研究与记忆与衰老项目(ROSMAP) 西奈山脑库(MSBB)研究 MayoRNAseq研究 Banner Sun Health Research Institute(Banner)研究 数据链接 ROS

基本信息
资源简介
衰老与阿尔茨海默脑中的RNA编辑_Yiyi Ma等
该数据集围绕衰老与阿尔茨海默病脑组织中的RNA编辑展开,标题为“RNA editing in the aging and Alzheimer brain_Yiyi Ma.etal”,从转录组与蛋白质组两个视角进行观察。数据集在来源站被归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病方向,来源站为synapse.org。其源站描述指出,该数据来自若干既有研究队列,包括宗教秩序研究与记忆与衰老项目(ROSMAP)、西奈山脑库(MSBB)研究、MayoRNAseq研究以及Banner Sun Health Research Institute(Banner)研究,并提供了指向这些研究详情页的链接。源站还列出了部分数据链接,例如ROSMAP的背外侧前额叶皮层bulk RNAseq数据入口。整体而言,该数据集聚焦于脑老化与阿尔茨海默病背景下RNA编辑变化的转录组和蛋白质组层面信息。
【数据集背景】
该数据集的主题是衰老与阿尔茨海默病脑中的RNA编辑,强调从转录组与蛋白质组两个角度进行考察。其来源站描述明确将研究背景与多个既有队列关联,包括ROSMAP、MSBB、MayoRNAseq以及Banner研究。这些队列在源站描述中被列为该数据所来源的研究,并附有相应的研究详情页链接。数据集本身在来源站被归入神经系统疾病/阿尔茨海默病分类,说明其应用领域与神经退行性疾病、特别是阿尔茨海默病相关。源站描述还以“RNA editing in the aging and Alzheimer brain: transcriptomic and proteomic perspectives”作为标题性说明,进一步点明其关注的是衰老与阿尔茨海默脑组织中的RNA编辑现象,并从转录组和蛋白质组两个层面呈现。
【数据内容】
源站描述中列出了数据链接,其中可见ROSMAP相关的背外侧前额叶皮层bulk RNAseq数据入口。该链接指向synapse.org上的一个具体数据表查询地址。除这一条链接外,源站描述中关于其他数据内容的具体条目、文件类型、样本数量、RNA编辑位点数量、蛋白质组数据细节等,均未在已提供的信息中展开。因此,关于数据内容更完整的组成,源站未提供。可以确认的是,数据集名称和源站描述均指向RNA编辑,并同时涉及转录组与蛋白质组视角,但具体的数据文件、表格结构、字段含义等,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源研究包括ROSMAP、MSBB、MayoRNAseq和Banner研究。源站描述中为这四项研究分别提供了指向adknowledgeportal.synapse.org研究详情页的链接。数据链接部分则给出了ROSMAP的背外侧前额叶皮层bulk RNAseq入口。关于这些研究各自的样本采集方式、受试者信息、脑区选择、测序平台、蛋白质组学方法等,源站未提供。因此,采集与来源的详细流程、伦理审批、知情同意等信息,源站未提供。
【适用场景】
根据数据集标题和分类,该数据集适用于与衰老和阿尔茨海默病相关的RNA编辑研究,尤其是从转录组和蛋白质组两个层面进行探索的场景。其来源站分类为神经系统疾病/阿尔茨海默病,表明其可服务于阿尔茨海默病及相关神经退行性疾病的机制研究、生物标志物探索或数据整合分析。由于源站描述提及ROSMAP、MSBB、MayoRNAseq和Banner研究,该数据集也可能适用于跨队列比较或与这些队列相关的转录组、蛋白质组联合分析。但具体适用场景的边界、推荐分析类型、是否适合临床诊断等,源站未提供。
【使用方法】
源站描述中提供了数据链接,例如ROSMAP的背外侧前额叶皮层bulk RNAseq数据入口,指向synapse.org上的查询页面。使用者可能需要通过synapse.org访问这些链接,并依据源站提供的入口获取相应数据。关于数据下载权限、是否需要注册、是否受控制访问、数据格式、预处理步骤、分析工具推荐等,源站未提供。因此,具体使用方法、访问流程和操作指南,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述中未提供关于数据质量、批次效应、样本量、覆盖度、重复性、验证情况或技术限制的说明。该数据集涉及多个来源研究,但各研究之间的数据一致性、标准化程度、潜在混杂因素等,源站未提供。此外,关于RNA编辑检测的灵敏度、特异性、假阳性控制,以及蛋白质组与转录组数据之间的对应关系,源站未提供。因此,质量与限制方面的具体信息,源站未提供。
【引用与许可】
源站描述中未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或授权信息。关于是否需要引用原始研究、是否允许再分发、是否允许商业使用等,源站未提供。因此,引用与许可相关内容,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://synapse.org/Synapse:syn22332843
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
衰老与阿尔茨海默病大脑中的RNA编辑:转录组学与蛋白质组学视角
有关本数据来源研究的信息,请参见
数据链接
ROSMAP
- 背外侧前额叶皮层 - 批量RNAseq
- [背外侧前额叶皮层/前扣带皮层/后扣带皮层 - 批量RNAseq](https://www.synapse.org/#!Synapse:syn11346063/tables/query/eyJzcWwiOiJTRUxF
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




