UHN人皮层神经元全细胞兴奋性记录

DANDI Archive 作为神经生理学数据归档与共享平台,提供该数据集的发布和访问入口。除上述信息外,关于该数据集产生的具体研究项目、科学问题、实验背景、机构背景以及 UHN 的具体含义,源站未提供

dandi
2021-12-24 更新
浏览 77
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UHN whole-cell excitability recordings from human cortical neurons

基本信息

模态
其他
任务类型
回归
创建/更新时间
2021-12-24
版本
draft

资源简介

UHN人皮层神经元全细胞兴奋性记录

该数据集英文名为 UHN whole-cell excitability recordings from human cortical neurons,来源为 dandiarchive.org 上的 DANDI Archive,编号 dandiset 000211,属于 NWB 标准的神经生理学数据集,内容指向人类皮层神经元的全细胞兴奋性记录;在分类上归入神经系统疾病 / 其他,联系人为 Howard, Derek。

【数据集背景】

该数据集是 DANDI Archive 中的 dandiset 000211,属于 BRAIN Initiative 相关的 NWB 标准神经生理学数据。DANDI Archive 作为神经生理学数据归档与共享平台,提供该数据集的发布和访问入口。除上述信息外,关于该数据集产生的具体研究项目、科学问题、实验背景、机构背景以及 UHN 的具体含义,源站未提供。

【数据内容】

数据内容围绕人类皮层神经元的全细胞兴奋性记录展开,属于神经生理学记录数据,并以 NWB 标准进行组织。数据集英文名称中明确出现了 whole-cell excitability recordings 与 human cortical neurons,说明其主题与人类皮层神经元的全细胞兴奋性测量有关。分类信息将其归入神经系统疾病 / 其他。关于记录涉及的具体脑区、细胞类型细分、样本数量、受试者信息、刺激或记录方案、电生理指标、文件数量、数据规模、时间跨度等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 dandiarchive.org,属于 DANDI Archive dandiset 000211,是 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Howard, Derek。关于采集机构、实验地点、采集设备、电极类型、操作流程、伦理审批、受试者招募与知情同意等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其为 NWB 标准的神经生理学数据集,通常可考虑用于神经生理学数据的读取、复用、方法比较以及基于 NWB 生态工具的分析工作流。由于数据集名称涉及人类皮层神经元的全细胞兴奋性记录,相关领域的研究者可能关注其在神经元兴奋性、皮层神经生理学等方向上的数据复用价值。不过,源站未提供该数据集明确规定的适用场景、推荐分析任务或预期用途,因此以上仅为一般性使用方向,不构成对该数据集具体属性的额外说明。

【使用方法】

可通过 dandiarchive.org 访问 DANDI Archive 中的 dandiset 000211,并依据该平台对 NWB 标准神经生理学数据的通用支持方式进行读取与使用。由于数据采用 NWB 标准,通常可借助支持 NWB 格式的工具进行浏览、提取与分析。关于具体下载步骤、是否需要账号或授权、API 调用方式、数据文件组织结构、依赖软件版本以及推荐分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供质量评估、质控指标、数据完整性说明、已知限制、使用注意事项或偏差风险等信息。使用者在复用该数据集时,应自行核查数据是否满足其研究目的。除 NWB 标准、来源站、编号、分类和联系人等已述信息外,源站没有给出更多关于质量与限制的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、版本信息、DOI、许可证类型、使用条款或再分发要求。联系人为 Howard, Derek。若需引用或确认许可条件,应以 dandiarchive.org 上该数据集的正式页面信息为准;但就目前提供的信息而言,引用与许可相关内容源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000211

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000211。符合 NWB 标准的神经生理学数据集(BRAIN Initiative)。联系人:Howard, Derek。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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