PXD003628：免疫突触形成过程中的 SNX27 相互作用组

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003628

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数据说明

T淋巴细胞对抗原呈递细胞（APC）表面抗原肽的识别导致免疫突触（IS）形成。与神经突触类似，这种细胞间通讯模型需要形成高度组织化的结构，以界定膜运输的活跃区域。为了使T细胞将抗原识别与生物反应联系起来，受体和信号蛋白必须被循环利用。分选连接蛋白27（SNX27）是一种内体蛋白，以其通过逆转录体运输机制循环利用PDZ（PSD95、Dlg1、ZO-1）相互作用的神经元蛋白的作用而闻名。这种分选途径的改变会导致神经退行性变，并与唐氏综合征、阿尔茨海默病和帕金森病相关。在T淋巴细胞中，SNX27与二酰甘油激酶ζ（DGKz）相互作用，从而在二酰甘油代谢与膜运输之间提供了机制联系。抗原识别后，SNX27阳性内体向IS极化，并且一个依赖PDZ的SNX27池在细胞间接触区域积聚。

为检测SNX27的其他功能，我们对与APC接触的T细胞中纯化的SNX27相互作用组进行了蛋白质组学分析，并鉴定出SNX27与逆转体以及WASH（Wiskott-Aldrich综合征蛋白和SCAR同源物）复合物成员的相互作用。这一发现表明SNX27/WASH/逆转体复合物在造血细胞中的保守性，并提示神经系统疾病与异常免疫/炎症反应之间存在相似性。我们还发现了PDZ依赖性的SNX27货物，包括细胞骨架重组的调节因子，如闭锁小带-2（ZO-2）。ZO-2是上皮细胞间连接的胞质组分，定位于免疫突触，且SNX27沉默影响了突触处ZO-2的稳定性。本研究拓宽了我们对SNX27在T淋巴细胞中功能的认识，并提示在上皮系统中界定极化结构的通路也参与免疫突触

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。