T淋巴细胞 TGFb+NE 数据集

数据覆盖两种培养条件下的转录组原始测序信息,可用于研究 TGF Beta 与 Norepinephrine 对 CD4+ T 淋巴细胞基因表达的影响,支持免疫系统疾病相关的基础分析与比较研究(来源 DOI 解析)

Texas Data RepositoryTexas Data Repository
dataverse
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基因组分类Medicine, Health and Life SciencesT-lymphocyteNorepinephrineTGF Beta
T-lymphocyte TGFb+NE Dataset

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

T淋巴细胞 TGFb+NE 数据集

T-lymphocyte TGFb+NE Dataset 是一个面向免疫系统疾病研究领域的转录组原始测序数据集,其英文名称直接体现了研究对象与实验条件:T 淋巴细胞在 TGF Beta 与 Norepinephrine 共同作用下的表达谱信息。该数据集由作者 Case, Adam 提交,存放于 Texas Data Repository,来源标识为 doi.org,发布时间标注为 2026 年。数据内容为在 TH17 或 TGFb+NE 两种培养条件下处理 24 小时的 naive CD4+ T 淋巴细胞的 bulk RNA sequencing 原始数据。数据集主题标签涵盖 Medicine, Health and Life Sciences、T-lymphocyte、Norepinephrine 与 TGF Beta,本站将其归入免疫系统疾病 / 其他分类。整体而言,该数据集提供了两种培养条件之间可比较的转录组原始测序信息,适合用于探索 TGF Beta 与 Norepinephrine 对 CD4+ T 淋巴细胞基因表达的影响,并支撑免疫系统疾病相关的基础分析与比较研究。

【数据集背景】

CD4+ T 淋巴细胞是免疫系统中承担辅助与调节功能的重要细胞群体,其分化方向与所处细胞因子环境密切相关。TGF Beta 作为一种具有广泛免疫调节作用的因子,与 Norepinephrine 这一神经递质共同作用于 T 细胞时可能影响其基因表达程序。该数据集正是在这一研究背景下产生,聚焦 naive CD4+ T 淋巴细胞在 TH17 条件或 TGFb+NE 条件下培养 24 小时后的转录组变化。数据集所属分类为免疫系统疾病 / 其他,主题标签同时包含 T-lymphocyte、Norepinephrine 与 TGF Beta,说明其设计意图在于为免疫系统疾病相关的基础研究提供原始测序层面的数据支撑。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 bulk RNA sequencing 原始数据,来源于 naive CD4+ T 淋巴细胞。实验设置包含两种培养条件:TH17 条件与 TGFb+NE 条件,培养时间均为 24 小时。数据覆盖这两种条件下的转录组原始测序信息,可用于研究 TGF Beta 与 Norepinephrine 对 CD4+ T 淋巴细胞基因表达的影响,并支持免疫系统疾病相关的基础分析与比较研究。关于样本数量、测序平台、读长、数据文件格式与体积等具体细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据由作者 Case, Adam 提交,机构为 Texas Data Repository,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。源站描述明确指出,该数据为 naive CD4+ T 淋巴细胞在 TH17 或 TGFb+NE 条件下培养 24 小时后获得的 bulk RNA sequencing 原始数据。除上述来源与实验条件信息外,关于样本采集、伦理审批、测序服务提供方等具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容与标签,该数据集适用于以下方向:研究 TGF Beta 与 Norepinephrine 对 CD4+ T 淋巴细胞基因表达的影响;比较 TH17 条件与 TGFb+NE 条件下培养 24 小时的转录组差异;作为免疫系统疾病相关基础分析与比较研究的原始数据来源;以及围绕 T 淋巴细胞、Norepinephrine 与 TGF Beta 主题开展的探索性分析。关于具体疾病模型或临床转化应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 bulk RNA sequencing 原始数据,使用时应先完成原始测序数据的质量控制、比对与定量等常规转录组处理步骤,再在 TH17 与 TGFb+NE 两种条件之间进行比较分析。由于数据为原始测序信息,使用者需自行准备相应的生物信息学分析流程与参考基因组资源。关于源站是否提供预处理数据、分析脚本或使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为原始测序数据,其质量取决于测序与建库过程,但源站未提供具体的测序深度、重复数、质控指标等信息,使用前需自行评估。实验条件限定为 naive CD4+ T 淋巴细胞、培养 24 小时、两种培养条件,结论外推至其他细胞类型、时间点或刺激条件时需谨慎。关于数据是否存在批次效应、样本量是否满足统计检验要求等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Case, Adam,机构为 Texas Data Repository,来源站为 doi.org,发布时间为 2026 年。使用时应通过 doi.org 对应的来源标识进行引用与溯源。关于具体的许可证类型、使用条款与引用格式,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.18738/T8/R6W6IA

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Bulk RNA sequencing raw data from naive CD4+ T-lymphocytes cultured under TH17 or TGFb+NE conditions for 24 hours

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