PD1抑制PKCθ依赖的细胞骨架相关蛋白磷酸化及免疫突触形成

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD044028

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞表面受体程序性死亡1（PD1）是基于抗体的癌症免疫疗法的主要靶点。为了更好地开发预测性和预后性生物标志物，需要更深入地了解PD1所靶向的细胞内信号通路。在此，通过对原发性人类T细胞进行无偏磷酸化蛋白质组分析，我们证明了PD1的触发减少了多种细胞骨架蛋白的磷酸化及其与PKC theta的物理结合。TCR诱导的波形蛋白磷酸化，一种在我们的研究中被鉴定为PKC theta靶点和结合伴侣的细胞骨架蛋白，被发现是持久的，并且被PD1触发持久抑制，而波形蛋白磷酸化与人类肺癌肿瘤内T细胞中的PDL1水平呈负相关。因此，PKCθ及其底物波形蛋白代表了PD1介导的T细胞抑制的重要靶点，低水平的波形蛋白磷酸化可被视为指示PD1通路参与的生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。