PXD008832：FFPE卵巢癌组织样本保存质量与活性评估

资源简介

PXD008832：FFPE卵巢癌组织样本保存质量与活性评估

PXD008832: Evaluation of preservation quality and viability of FFPE ovarian cancer tissue samples 是一个来源于 ebi.ac.uk 的数据集，围绕 60 例福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）卵巢癌组织样本展开，目的是评估这些样本的保存质量，以及开展全局蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析的可行性。

【数据集背景】

卵巢癌相关的蛋白质组学研究常需要处理临床组织样本。FFPE 是病理样本长期保存的常见方式，但其固定和包埋过程可能影响后续分子分析。该数据集正是针对这一背景，分析 60 例 FFPE 卵巢癌组织样本，考察保存质量与全局、磷酸化蛋白质组学分析之间的关系。当前分类归入肿瘤 / 其他，主题标签包括 Ovarian cancer、Proteomics、Ffpe、Phosphoproteomics，物种标注为 Homo sapiens (human)，对应 NEWT:9606。

【数据内容】

内容主体是 60 例 FFPE 卵巢癌组织样本的分析，涉及全局蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学两个层面。数据集关注保存质量与 viability，即样本是否适合开展上述蛋白质组学分析。除样本数量、样本类型、物种和分析类型外，具体文件格式、原始谱图数量、鉴定蛋白数、磷酸化位点数、样本临床注释等信息源站未提供。

【采集与来源】

来源站为 ebi.ac.uk，数据集标识为 PXD008832。样本来自卵巢癌组织，采用 FFPE 保存形式，物种为人类（Homo sapiens，NEWT:9606）。研究描述明确为“Analysis of 60 FFPE ovarian cancer tissue samples to evaluate preservation quality and viability of global and phosphoproteomic analysis”。采集机构、采集时间、地理区域、伦理审批、样本入组标准等细节源站未提供。

【适用场景】

可用于关注 FFPE 样本保存质量评估的方法学研究，也可用于卵巢癌蛋白质组学与磷酸化蛋白质组学数据分析的参考。对于需要了解 FFPE 组织能否支持全局蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析的场景，该数据集提供了以 60 例卵巢癌样本为基础的分析对象。是否适合特定生物标志物发现、临床转化研究或跨平台比较，需结合原始数据与具体研究设计；源站未提供具体适用建议。

【使用方法】

关于数据下载方式、文件组织、检索接口、分析流程、软件参数和复现步骤，源站未提供。使用者应以 ebi.ac.uk 对应页面说明为准，并根据自身研究目的判断是否使用该数据集。源站未提供逐步操作指南。

【质量与限制】

该数据集的核心目的之一是评估 FFPE 样本的保存质量及其对全局和磷酸化蛋白质组学分析的可行性，因此保存质量是重要关注点。样本量为 60 例，全部为 FFPE 卵巢癌组织。具体质量指标、缺失值比例、批次效应、定量准确性、磷酸化富集效率等源站未提供。数据集仅覆盖卵巢癌 FFPE 样本，是否可外推到其他癌种或其他保存方式，源站未提供。使用时应关注 FFPE 样本可能带来的技术限制，但具体限制程度源站未提供。

【引用与许可】

数据集来源站为 ebi.ac.uk，标识为 PXD008832。引用格式、许可条款、使用限制、联系人信息和相关发表文献等，源站未提供。使用或再分发前应查阅来源站页面的最新说明。