阿尔茨海默数据透镜

阿尔茨海默病-omics数据分析与可视化平台,提供生物信息学管道和网络界面。

ayushnooriayushnoori
GitHub
2021-12-16 更新
浏览 63
基因组alzheimercs50omics
Alzheimer DataLENS

基本信息

模态
基因组
大小
0.006156 GB
许可
GPL-3.0
创建/更新时间
2021-12-16
版本
master

资源简介

阿尔茨海默数据透镜

【数据集背景】

本数据集源站标题为《ayushnoori/datalens》。源站首次发布:2021-12-03。

【数据内容】

源站原始描述:Open data analysis platform for Alzheimer''s disease. Created for CS50 at Harvard College. # About DataLENS Alzheimer DataLENS is an open data analysis platform which aims to advance Alzheimer’s disease (AD; see *About Alzheimer’s Disease* below) research by enabling the analysis, visualization, and sharing of -omics data. DataLENS houses bioinformatics pipelines for the analysis of -omics data on Alzheimer’s disease and related dementias (ADRD) as well as streamlined web interfaces which allow n…

【主题与分类】

主题标签:alzheimer、cs50、omics。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://github.com/ayushnoori/datalens

使用许可:GPL-3.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2021-12-16,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/ayushnoori/datalens.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/ayushnoori/datalens/archive/refs/heads/master.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

Installation

DataLENS is an R Shiny web application
with an HTML/CSS/JavaScript front-end, an R back-end, and a
MongoDB database.

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

完整仓库:github.com/ayushnoori/datalens

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案