Marioni等阿尔茨海默病家族史GWAS汇总统计量2019年6月校正数据
数据以空格分隔的文本文件形式提供,每个 .txt 文件包含超过七百万行,并带有表头行,列信息见 readme 文件。可用于阿尔茨海默病家族史的遗传关联分析及相关遗传学研究,但需注意常规文本编辑器与 Excel 2016 无法完整显示全部行(来源 datashare.ed.ac.uk)

基本信息
资源简介
Marioni等阿尔茨海默病家族史GWAS汇总统计量2019年6月校正数据
Marioni_et_al_AD_GWAS_Sumstats_June2019_Correction 是一个与阿尔茨海默病遗传学研究相关的数据集,其内容用于支持 Marioni 等人发表的关于阿尔茨海默病家族史的全基因组关联研究(GWAS)论文。该数据集来源于 datashare.ed.ac.uk,在本站归类于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病方向。数据以空格分隔的文本文件形式提供,每个 .txt 文件包含超过七百万行,并带有表头行,具体列信息记录在 readme 文件中。该数据集可用于阿尔茨海默病家族史的遗传关联分析及相关遗传学研究,但使用者需要注意,常规文本编辑器以及 Microsoft Excel 2016 无法完整显示全部行,直接打开可能遇到困难。
【数据集背景】
该数据集所支持的论文为 Marioni, RE, Harris, SE, Zhang, Q, Mcrae, AF, Hagenaars, SP, Hill, WD, Davies, G, Ritchie, CW, Gale, CR, Starr, JM, Goate, AM, Porteous, DJ, Yang, J, Evans, KL, Deary, IJ, Wray, NR & Visscher, PM 2018 年发表的 “GWAS on family history of Alzheimer’s disease”,刊登于 Translational Psychiatry 第 8 卷第 1 期,DOI 为 10.1038/s41398-018-0150-6。数据集名称中包含 June2019_Correction,表明该版本可能与 2019 年 6 月的更正有关。数据集的主题标签包括 ageing、Alzheimer's disease、GWAS 和 genetics,说明其研究背景涉及衰老、阿尔茨海默病、全基因组关联分析以及遗传学。
【数据内容】
数据以空格分隔的文本文件形式提供,每个 .txt 文件包含超过七百万行,并带有表头行。文件中的列信息列在 readme 文件中。源站描述特别提示,每个 .txt 文件均超过七百万行,使用 Notepad++ 或 Microsoft Notepad 查看内容时会遇到困难,Microsoft Excel 2016 也无法显示所有行。因此,该数据集属于大规模文本型汇总统计数据,适合通过能够处理大文件的工具进行读取和分析。
【采集与来源】
该数据集来源站为 datashare.ed.ac.uk。源站描述说明,这些数据用于支持上述 Marioni 等人的论文。除来源站和所支持论文的信息外,关于数据采集的具体流程、样本来源、伦理审批、数据生成平台等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于阿尔茨海默病家族史的遗传关联分析及相关遗传学研究。结合其主题标签,潜在使用方向包括衰老、阿尔茨海默病、GWAS 和遗传学领域的研究。由于数据为 GWAS 汇总统计数据,通常可用于遗传关联信号的查阅、比较或后续分析。但具体分析类型、统计模型和适用范围,源站未提供。
【使用方法】
使用者应以能够处理大文件的软件或编程环境读取这些空格分隔的文本文件。每个文件带有表头行,列的具体含义需参考 readme 文件。由于每个 .txt 文件超过七百万行,常规文本编辑器如 Notepad++ 或 Microsoft Notepad 在查看时会出现困难,Microsoft Excel 2016 也无法显示所有行。因此,建议避免使用上述工具直接打开完整文件,而应采用适合大文本数据处理的方式。关于具体的读取命令、软件包或分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主要限制在于文件规模较大,每个 .txt 文件超过七百万行,导致常规文本编辑器和 Microsoft Excel 2016 无法完整显示全部行。使用者需要具备处理大文件的计算环境。此外,数据以空格分隔的文本格式提供,列信息依赖 readme 文件。关于数据质量评估、缺失值情况、统计效力、群体分层、校正内容的具体细节,源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时,应引用其所支持的论文:Marioni, RE, Harris, SE, Zhang, Q, Mcrae, AF, Hagenaars, SP, Hill, WD, Davies, G, Ritchie, CW, Gale, CR, Starr, JM, Goate, AM, Porteous, DJ, Yang, J, Evans, KL, Deary, IJ, Wray, NR & Visscher, PM 2018, 'GWAS on family history of Alzheimer’s disease' Translational Psychiatry, vol. 8, no. 1. DOI: 10.1038/s41398-018-0150-6。关于该数据集的许可条款、使用限制或再分发条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/3364
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
支持该论文的数据:Marioni, RE, Harris, SE, Zhang, Q, Mcrae, AF, Hagenaars, SP, Hill, WD, Davies, G, Ritchie, CW, Gale, CR, Starr, JM, Goate, AM, Porteous, DJ, Yang, J, Evans, KL, Deary, IJ, Wray, NR & Visscher, PM 2018,“阿尔茨海默病家族史的全基因组关联研究(GWAS)”,Translational Psychiatry,第8卷,第1期。DOI:10.1038/s41398-018-0150-6。 ## 关于使用这些文件的说明 ## 每个 .txt 文件包含超过七百万行。如果用户尝试使用 Notepad++ 或 Microsoft Notepad 查看内容,将会遇到困难。Microsoft Excel 2016 无法显示所有行。这些以空格分隔的文本文件包含若干列,并带有表头行;readme 文件中列出了这些列。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




