下肢静脉曲张全基因组关联研究汇总统计数据

该数据集是关于下肢静脉曲张的全基因组关联研究汇总统计数据,包含发现阶段(基于337,199名UK Biobank个体)和重复阶段(基于71,256名个体)的遗传关联结果,数据模态主要为基因型统计摘要(如SNP、效应值、P值等),主要用于研究下肢静脉曲张的遗传学基础、识别易感基因位点,并为后续的遗传流行病学分析和疾病机制探索提供支持。

Laboratory of Pharmacogenomics, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, NovosibirskLaboratory of Pharmacogenomics, Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk
Zenodo
2020-09-20 更新
浏览 50
varicosevaricose veins of lower extremitiesgeneticsgwas
Genome-wide association summary statistics for varicose veins of lower extremities

基本信息

大小
0.73 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2020-09-20
版本
v1

资源简介

下肢静脉曲张全基因组关联研究汇总统计数据

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genome-wide association summary statistics for varicose veins of lower extremities》。源站首次发布:2018-07-30。

【数据内容】

源站原始描述:The dataset contains summary statistics for the discovery and the replication stages of the large-scale genome-wide associations study for varicose veins of lower extremities. The discovery stage was based on genetic association data provided by the Neale Lab ( ) for 337,199 UK biobank individuals. Phenotype “varicose veins of lower extremities” was defined based on International Classification of Disease (ICD-10) billing code “I83” present in the electronic patient recor…

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 728.39 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.1323484。

【主题与分类】

主题标签:varicose、varicose veins of lower extremities、genetics、gwas。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/1323484

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2020-01-24,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/record/1323484

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数据说明

该数据集包含针对下肢静脉曲张的大规模全基因组关联研究(GWAS)的发现阶段和重复阶段汇总统计数据。发现阶段基于Neale实验室提供的337,199名英国生物样本库个体的遗传关联数据,表型根据电子病历中的国际疾病分类(ICD-10)编码“I83”定义,并针对体重指数和深静脉血栓形成两个潜在混杂因素进行了调整。重复队列(N=71,256)通过对两个重叠数据集(来自Gene ATLAS数据库的408,455名UK Biobank参与者数据以及上述Neale实验室数据)进行反向荟萃分析生成。数据集以“按现状提供(AS-IS)”为基础,包含SNP、效应大小、标准误、P值、染色体位置、等位基因等字段。该数据主要用于下肢静脉曲张的遗传学基础研究、风险基因位点识别以及后续的遗传流行病学分析。

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