结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮中NTRK3启动子甲基化数据集

该数据集提供了结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮组织中NTRK3基因启动子甲基化的定量数据,数据模态为表观遗传学甲基化测量值,通过优化的PMR阈值区分不同组织类型,主要用于结直肠癌的早期诊断、表观遗传标志物研究及疾病进展机制探索。

Figshare
2015-12-02 更新
浏览 42
geneticsepigeneticsDNA modificationCancer geneticsMolecular cell biologyCell deathGastroenterology and hepatologyGastrointestinal cancersoncologyCancers and neoplasmsGastrointestinal tumorsColon adenocarcinoma
NTRK3 Promoter Methylation in Colorectal Adenocarcinoma, Adenoma and Normal Colon Epithelium

基本信息

大小
0.000005632 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2015-12-02
版本
v1

资源简介

结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮中NTRK3启动子甲基化数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《NTRK3 promoter methylation in colorectal adenocarcinoma, adenoma and normal colon epithelium.》。配套论文《NTRK3 Is a Potential Tumor Suppressor Gene Commonly Inactivated by Epigenetic Mechanisms in Colorectal Cancer》发表于 PLoS Genetics(2013),DOI:10.1371/journal.pgen.1003552。源站首次发布:2013-07-11。

【数据内容】

源站原始描述:¶Methylation was scored as being present in a case if the PMR >13.7. The PMR threshold was optimized by using ROC analysis on cancer and normal samples with an area under the curve (AUC) of 0.843. ‡“Cancer-free patients” indicates that the patient did not have colorectal cancer

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 5.63 KB。Table_1.xls:application/vnd.ms-excel,5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pgen.1003552.t001。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Biological Sciences。主题标签:genetics、epigenetics、DNA modification、Cancer genetics、Molecular cell biology、Cell death、Gastroenterology and hepatology、Gastrointestinal cancers、oncology、Cancers and neoplasms。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_NTRK3_promoter_methylation_in_colorectal_adenocarcinoma_adenoma_and_normal_colon_epithelium_/743939

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Luo, Yanxin; M. Kaz, Andrew; Kanngurn, Samornmas; Welsch, Piri; M. Morris, Shelli; Wang, Jianping; et al. (2015). NTRK3 promoter methylation in colorectal adenocarcinoma, adenoma and normal colon epithelium.. PLOS Genetics. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/_NTRK3_promoter_methylation_in_colorectal_adenocarcinoma_adenoma_and_normal_colon_epithelium_/743939

按页面 Download 按钮获取。

数据说明

该数据集研究结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮组织中NTRK3基因启动子区域的甲基化状态。数据包含通过ROC曲线分析优化的甲基化阈值(PMR >13.7),该阈值在区分癌组织与正常组织时曲线下面积(AUC)达0.843。数据集涵盖结直肠腺癌患者、腺瘤患者及无结直肠癌的对照样本,主要用于结直肠癌表观遗传学研究,探索NTRK3基因甲基化作为潜在生物标志物的诊断价值。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案