结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮中NTRK3启动子甲基化数据集
该数据集提供了结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮组织中NTRK3基因启动子甲基化的定量数据,数据模态为表观遗传学甲基化测量值,通过优化的PMR阈值区分不同组织类型,主要用于结直肠癌的早期诊断、表观遗传标志物研究及疾病进展机制探索。

基本信息
资源简介
结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮中NTRK3启动子甲基化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《NTRK3 promoter methylation in colorectal adenocarcinoma, adenoma and normal colon epithelium.》。配套论文《NTRK3 Is a Potential Tumor Suppressor Gene Commonly Inactivated by Epigenetic Mechanisms in Colorectal Cancer》发表于 PLoS Genetics(2013),DOI:10.1371/journal.pgen.1003552。源站首次发布:2013-07-11。
【数据内容】
源站原始描述:¶Methylation was scored as being present in a case if the PMR >13.7. The PMR threshold was optimized by using ROC analysis on cancer and normal samples with an area under the curve (AUC) of 0.843. ‡“Cancer-free patients” indicates that the patient did not have colorectal cancer
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 5.63 KB。Table_1.xls:application/vnd.ms-excel,5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pgen.1003552.t001。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Biological Sciences。主题标签:genetics、epigenetics、DNA modification、Cancer genetics、Molecular cell biology、Cell death、Gastroenterology and hepatology、Gastrointestinal cancers、oncology、Cancers and neoplasms。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_NTRK3_promoter_methylation_in_colorectal_adenocarcinoma_adenoma_and_normal_colon_epithelium_/743939
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Luo, Yanxin; M. Kaz, Andrew; Kanngurn, Samornmas; Welsch, Piri; M. Morris, Shelli; Wang, Jianping; et al. (2015). NTRK3 promoter methylation in colorectal adenocarcinoma, adenoma and normal colon epithelium.. PLOS Genetics. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集研究结直肠腺癌、腺瘤及正常结肠上皮组织中NTRK3基因启动子区域的甲基化状态。数据包含通过ROC曲线分析优化的甲基化阈值(PMR >13.7),该阈值在区分癌组织与正常组织时曲线下面积(AUC)达0.843。数据集涵盖结直肠腺癌患者、腺瘤患者及无结直肠癌的对照样本,主要用于结直肠癌表观遗传学研究,探索NTRK3基因甲基化作为潜在生物标志物的诊断价值。
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