阿尔茨海默病5xfAD小鼠模型的微生物组与代谢组纵向分析

本数据集来自 search.dataone.org,针对家族性阿尔茨海默病常用转基因小鼠模型 5xfAD,提供纵向的微生物组与代谢组数据

dataone
浏览 12
基因组分类Mouse metabolomeMicrobiomePlasma MetabolomeAlzheimer’s diseaseMODEL-ADFecal MetabolomeMetabolomicsfecal microbiomegut-brain axiscecal microbiome
Longitudinal analysis of the microbiome and metabolome in the 5xfAD mouse model of Alzheimer's disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

阿尔茨海默病5xfAD小鼠模型的微生物组与代谢组纵向分析

Longitudinal analysis of the microbiome and metabolome in the 5xfAD mouse model of Alzheimer's disease

本数据集来自 search.dataone.org,针对家族性阿尔茨海默病常用转基因小鼠模型 5xfAD,提供纵向的微生物组与代谢组数据。数据包含盲肠和粪便样本的宏基因组、粪便样本代谢组以及血浆代谢组,样本采集自 5xfAD 小鼠及其 WT B6J 同窝仔鼠,年龄覆盖 4 至 18 个月。研究探讨了微生物组与代谢物组成在基因型、性别、年龄和饲养条件方面的差异,属于 MODEL-AD 联盟工作的一部分,可用于阿尔茨海默病中肠脑轴相关研究(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在此,我们评估了家族性阿尔茨海默病常用转基因小鼠模型(5xfAD)的纵向微生物组和代谢组。该数据由盲肠和粪便样本的宏基因组学、粪便样本的代谢组学以及血浆的代谢组学组成。样本采集自 5xfAD 小鼠及其 WT B6J 同窝仔鼠,年龄为 4 至 18 个月。研究探讨了微生物组和代谢物组成与基因型、性别、年龄和饲养条件相关的差异。本研究是 MODEL-AD 联盟(model-ad.org)工作的一部分。

【主题与分类】

主题标签:Mouse metabolome、Microbiome、Plasma Metabolome、Alzheimer’s disease、MODEL-AD、Fecal Metabolome、Metabolomics、fecal microbiome、gut-brain axis、cecal microbiome。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Aba5d8bf3d198d266178be930ea5a6088517c3a08caf900dd1a348a0ad8bdb9e3

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3Aba5d8bf3d198d266178be930ea5a6088517c3a08caf900dd1a348a0ad8bdb9e3

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此,我们评估了一种用于家族性阿尔茨海默病的流行转基因小鼠模型(5xfAD)的纵向微生物组和代谢组。该数据包括盲肠和粪便样本的宏基因组学、粪便样本的代谢组学以及血浆的代谢组学。样本采集自4至18个月龄的5xfAD小鼠及其野生型B6J同窝仔鼠。我们探讨了微生物组和代谢物组成与基因型、性别、年龄及饲养条件之间的关系。本研究作为MODEL-AD联盟(model-ad.org)的一部分进行。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案