GSE344288：Rhpn2在斑马鱼体内促进黑色素瘤发生与侵袭性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344288

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数据说明

黑色素瘤是转移性最强、多药耐药性最显著的癌症之一，也是皮肤癌导致死亡的首要原因。这种复杂的疾病需要识别参与其进展、侵袭和转移的其他协同事件，以加强治疗手段。RhoGTP酶在癌症发生和转移中发挥关键作用。Rhophilin-2（RHPN2）是一种Rho效应因子，在多种人类癌症中发生扩增，但其在黑色素瘤中的作用尚未被探索。在此，我们将人类黑色素瘤细胞中的敲低实验与斑马鱼中的敲除和过表达实验相结合，以揭示RHPN2在黑色素瘤发生中的作用。我们证明，在人类黑色素瘤细胞中，RHPN2促进细胞生长以及克隆形成、迁移和侵袭特性。利用NRASQ61L和BRAFV600E斑马鱼模型，我们首次提供了体内证据，表明Rhpn2促进黑色素瘤的发生和发展。对Rhpn2缺陷肿瘤的组织学分析显示，细胞密度降低，且侵袭性肿瘤/基质边界处缺乏初级纤毛结构。

Rhpn2基因敲除黑色素瘤的转录组分析显示，IFN1响应基因表达增加，以及参与脂质代谢和纤毛功能的基因受到调节。这些发现共同表明，RHPN2是黑色素瘤的一个调节因子，为将其视为削弱肿瘤发展的靶点提供了新的视角。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。