卵巢癌中POTE基因的表观遗传激活
该数据集包含卵巢癌(特别是高级别浆液性癌)和正常输卵管上皮的RNA测序与DNA甲基化组数据,主要研究POTE基因家族在卵巢癌中的表达调控机制,涉及表观遗传修饰如DNA低甲基化、LINE-1序列变化及着丝粒周围激活,旨在探索POTE基因过表达与化疗耐药、患者生存率的关系,并为表观遗传靶向治疗提供数据支持。
创建时间2019-04-08
更新时间2019-04-08
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Epigenetic_activation_of_i_POTE_i_genes_in_ovarian_cancer/7724987
官方服务
帮我联系如需原始数据获取支持或标注服务,请联系我们。
资源简介
该数据集聚焦于卵巢癌中POTE基因家族的表观遗传调控机制研究。数据包含来自卵巢癌(特别是高级别浆液性癌HGSC)和正常输卵管上皮(FTE)的RNA测序和DNA甲基化组数据,分析了POTE基因(如POTE C, E, F)的表达变化及其与DNA低甲基化(包括全局、POTE特异性LINE-1序列及5'启动子/增强子区域)的关联。数据来源为患者样本和细胞系实验,通过地西他滨处理、DNMT敲除细胞系以及组蛋白去乙酰化酶(HDAC)和组蛋白甲基转移酶(HMT)靶向药物组合验证了DNA甲基化对POTE表达的抑制作用。主要研究方向包括探索POTE作为癌症-睾丸抗原(CTA)在卵巢癌中的过表达机制、表观遗传改变(如着丝粒周围激活、低甲基化)与化疗耐药及生存率的关系,以及潜在的表观遗传治疗靶点。
精度瓶颈?数据缺失?
当前公开数据无法满足您的算法精度?千方提供针对 卵巢癌 的高质量、多模态真实临床数据定制解决方案。