卵巢癌干细胞系的独特代谢反应

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS150

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数据说明

背景
肿瘤代谢正逐渐成为肿瘤研究中的一个重要焦点领域。然而，许多细胞代谢研究是在体外细胞培养条件下进行的，这些条件与体内肿瘤条件差异极大，而体内肿瘤条件的特点是氧、葡萄糖等营养物质以及化疗药物等其他分子的水平存在波动。此外，了解肿瘤中多种细胞类型，包括被认为是癌症复发主要原因的肿瘤干细胞，如何响应这些波动十分重要。在此，利用旨在模拟体内环境不同方面的体外环境扰动，来表征一株卵巢癌细胞系及其衍生的同基因型肿瘤干细胞如何在代谢上响应环境信号。

结果
采用质谱法分析了响应体外环境扰动的代谢物水平。本实验所用化疗药物多西他赛使卵巢癌细胞的氨基酸和碳水化合物代谢发生了显著变化，但对同基因型卵巢癌干细胞几乎没有代谢影响。葡萄糖剥夺、缺氧及其组合对卵巢癌细胞和肿瘤干细胞代谢的改变程度因这两种细胞类型而异。缺氧对卵巢癌细胞代谢的影响大得多，而葡萄糖剥夺对卵巢癌干细胞代谢的影响更大。研究识别出受这些扰动影响的核心代谢物和通路，以及细胞类型或扰动所特有的通路。

结论
卵巢癌细胞系及其衍生的同基因型肿瘤干细胞在大多数条件下的代谢反应差异很大，提示这两种细胞类型在体内肿瘤微环境中可能表现得相当不同。尽管肿瘤代谢和肿瘤干细胞各自都是有前景的潜在治疗靶点，但如此多样的行为……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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