基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-25

资源简介

PRJNA792009：成釉细胞瘤细胞系资源

PRJNA792009 是一个围绕成釉细胞瘤（Ameloblastoma，AB）细胞系资源建立的数据集，来源为 ebi.ac.uk，在本站归入肿瘤 / 其他分类。成釉细胞瘤是一种对颌骨具有局部破坏性的牙源性肿瘤，临床治疗以手术切除为主，但该肿瘤常出现局部复发。近年来，研究者已在 MAPK 和 Hedgehog 通路中鉴定出驱动突变，然而由于缺乏成釉细胞瘤细胞系模型，这些发现向分子靶向治疗的转化受到阻碍。该数据集对应的研究目标正是建立一套能够反映成釉细胞瘤驱动突变谱的新型细胞系资源。研究者创建了 6 个新的成釉细胞瘤细胞系，并通过靶向外显子测序确定了这些细胞系的驱动突变，同时展示了它们在癌基因依赖性和药物敏感性临床前研究中的效用，相关研究还包括全转录组测定。该数据集为成釉细胞瘤的基础研究与临床前研究提供了细胞模型层面的资源支撑。

【数据集背景】

成釉细胞瘤是一种对颌骨具有局部破坏性的牙源性肿瘤。治疗 entails 手术切除，但该肿瘤常发生局部复发。近期研究已在 MAPK 和 Hedgehog 通路中鉴定出驱动突变，为分子靶向治疗提供了潜在方向。然而，从突变发现到分子靶向治疗的转化受到缺乏成釉细胞瘤细胞系模型的阻碍。为应对这一瓶颈，相关研究致力于创建一套新的成釉细胞瘤细胞系资源，使其能够反映成釉细胞瘤驱动突变的谱系，从而为后续的癌基因依赖性研究、药物敏感性评估以及全转录组测定提供可用的细胞模型基础。

【数据内容】

该数据集对应的资源核心是 6 个新建立的成釉细胞瘤细胞系。围绕这些细胞系，研究者通过靶向外显子测序确定了它们的驱动突变，从而在细胞模型层面刻画了与 MAPK 和 Hedgehog 通路相关的驱动突变特征。此外，研究展示了这些细胞系在癌基因依赖性和药物敏感性临床前研究中的效用，并包含全转录组测定。就本站分类而言，该数据集归入肿瘤 / 其他。除上述内容外，源站未提供关于数据文件类型、样本数量明细、测序深度、转录组数据具体格式等更细粒度的描述。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，数据集英文名称为 PRJNA792009: Ameloblastoma cell line resource。其资源建立过程包括创建 6 个新的成釉细胞瘤细胞系，并对这些细胞系进行靶向外显子测序以定义驱动突变；研究中还涉及全转录组测定，用于展示细胞系在临床前研究中的效用。关于样本采集地点、患者来源信息、伦理审批信息、细胞系建系的具体实验流程等，源站未提供。

【适用场景】

基于现有描述，该数据集适用于成釉细胞瘤的临床前研究场景，尤其是围绕 MAPK 和 Hedgehog 通路驱动突变的癌基因依赖性研究和药物敏感性研究。由于资源中包含反映成釉细胞瘤驱动突变谱的 6 个细胞系，并配有靶向外显子测序定义的驱动突变信息以及全转录组测定，其潜在用途包括在细胞模型层面开展分子靶向治疗的转化研究。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件组织说明、分析流程或软件要求等。

【质量与限制】

该数据集对应的研究通过靶向外显子测序定义细胞系的驱动突变，并展示了细胞系在癌基因依赖性和药物敏感性临床前研究中的效用，同时包含全转录组测定。就资源规模而言，研究创建了 6 个新的成釉细胞瘤细胞系。关于数据质量评估指标、批次效应、细胞系传代稳定性、数据完整性验证等信息，源站未提供。该资源旨在反映成釉细胞瘤驱动突变谱，但其覆盖范围与代表性程度在现有描述中未作进一步说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

原始链接

https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA792009

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA792009

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

成釉细胞瘤（AB）是一种对颌骨具有局部破坏性的牙源性肿瘤。治疗包括手术切除，但AB常发生局部复发。近期已鉴定出MAPK和Hedgehog通路中的驱动突变。然而，由于缺乏AB细胞系模型，向分子靶向治疗的转化受到阻碍。我们研究的目标是创建一种新的AB细胞系资源，以反映AB驱动突变的谱系。我们创建了6个新的AB细胞系，并通过靶向外显子组测序确定了它们的驱动突变。我们展示了这些细胞系在癌基因依赖性和药物敏感性临床前研究中的实用性（包括全转录组检测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别