PDMR PDX 894883-131-R 肛门鳞状细胞癌

主题标签:肛门鳞状细胞癌、PDX、PDMR、突变、表达、免疫标志物、患者治疗。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肛门鳞状细胞癌。

biostudies
浏览 18
基因组肛门鳞状细胞癌PDXPDMR突变表达免疫标志物患者治疗
[PDMR] [PDX] [894883-131-R] Anal Squamous Cell Carcinoma

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

PDMR PDX 894883-131-R 肛门鳞状细胞癌

该数据集英文名称为 [PDMR] [PDX] [894883-131-R] Anal Squamous Cell Carcinoma,在站内归入肿瘤 / 其他分类,来源站为 ebi.ac.uk。数据集围绕肛门鳞状细胞癌(Anal Squamous Cell Carcinoma)这一主题组织,涉及 PDX(人源肿瘤异种移植模型)、PDMR 相关资源体系,并涵盖突变、表达、免疫标志物以及患者治疗等信息维度。从源站描述看,该条目对应编号 S-CMO5139 与 894883-131-R,属于公开可获取的肿瘤研究数据资源,可为肛门鳞状细胞癌的基础研究与转化研究提供模型与分子层面的参考材料。

【数据集背景】

肛门鳞状细胞癌是肿瘤研究中的一类特定病种,围绕其建立可共享的数据资源有助于研究者获取模型与分子特征信息。该数据集以 PDX 模型为核心线索之一,与 PDMR 资源体系相关联,编号为 894883-131-R,源站条目编号为 S-CMO5139。数据集在站内被归入肿瘤 / 其他类别,说明其定位为肿瘤领域的专题数据资源。源站描述中同时出现了 PDMR 与 PDX 两类标识,表明该条目处于患者来源数据与异种移植模型数据的交汇位置,服务于肛门鳞状细胞癌相关研究。

【数据内容】

数据集主题涵盖肛门鳞状细胞癌、PDX、PDMR、突变、表达、免疫标志物与患者治疗等方面。据此,数据内容涉及该病种的突变信息、表达信息、免疫标志物信息以及患者治疗相关信息,并与 PDX 模型相关联。源站描述中未给出具体的基因列表、变异位点、表达量数值、标志物名称或治疗方案细节。数据的具体记录条数、字段结构、文件格式与数据规模,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。源站描述中给出了指向 pdmdb.cancer.gov 的条目链接(含 SPECIMENSEQNBR 参数 1913)以及 pdmr.cancer.gov 的数据请求页面链接,说明数据条目在 PDMR 相关平台上具有对应的记录入口与请求渠道。样本采集的具体地点、时间跨度、伦理审批信息以及模型建立的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于肛门鳞状细胞癌相关的肿瘤研究,例如围绕 PDX 模型开展的分子特征分析、突变与表达层面的探索、免疫标志物相关研究,以及结合患者治疗信息的转化研究。数据集亦可作为 PDMR 资源体系中的条目用于数据检索与资源定位。具体的适用研究设计、分析流程与验证方案,源站未提供。

【使用方法】

源站描述中提供了 PDMR 数据请求页面链接,表明使用者可通过该请求渠道获取数据。数据的具体下载方式、访问权限设置、请求审批流程与使用条款细节,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述中未给出数据质量评估指标、质控流程、样本量、完整性或准确性说明。该数据集聚焦于肛门鳞状细胞癌单一病种,覆盖范围有限;其具体局限性与偏倚情况,源站未提供。

【引用与许可】

源站描述中未提供引用格式、许可协议或使用授权条款的具体内容。相关引用与许可信息,源站未提供。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO5139

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

S-CMO5139 894883-131-R [PDMR] [PDX] [894883-131-R] Anal Squamous Cell Carcinoma PDX Anal Squamous Cell Carcinoma N/A mutation expression immune markers patient treatment Yes https://pdmdb.cancer.gov/pls/apex/f?p=101:4:0::NO:4:P4_SPECIMENSEQNBR:1913 https://pdmr.cancer.gov/request/default.htm

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。