PDMR PDX 355891-322-R 肛门鳞状细胞癌

主题标签:肛门鳞状细胞癌、PDX模型、PDMR、突变数据、表达数据、免疫标志物。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肛门鳞状细胞癌。

biostudies
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基因组分类肛门鳞状细胞癌PDX模型PDMR突变数据表达数据免疫标志物
[PDMR] [PDX] [355891-322-R] Anal Squamous Cell Carcinoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

PDMR PDX 355891-322-R 肛门鳞状细胞癌

该数据集英文名称为 [PDMR] [PDX] [355891-322-R] Anal Squamous Cell Carcinoma,本站归类为肿瘤 / 其他,来源站为 ebi.ac.uk。数据集围绕肛门鳞状细胞癌(Anal Squamous Cell Carcinoma)这一主题构建,属于 PDMR 与 PDX 体系下的公开肿瘤数据资源,标识编号为 355891-322-R,对应样本编号 S-CMO5665。从主题标签看,内容涉及肛门鳞状细胞癌、PDX 模型、PDMR、突变数据、表达数据与免疫标志物,可为肿瘤基础研究与转化研究提供模型与分子层面的参考信息。源站还提供了指向 PDMR 数据门户的样本页面链接以及数据申请页面链接,并标注该资源由 EMBL-EBI 提供。以下依据可获得的信息对该数据集作分段说明。

【数据集背景】

该数据集面向肛门鳞状细胞癌研究。肛门鳞状细胞癌是肿瘤领域的一种特定癌种,本数据集以该癌种为主题,并采用 PDX(患者来源异种移植)模型与 PDMR 相关资源体系进行组织。源站描述中同时出现 S-CMO5665 与 355891-322-R 两个标识,前者为样本层面的编号,后者为数据集名称中的编号,二者共同指向同一份肛门鳞状细胞癌 PDX 资源。数据集在本站被归入“肿瘤 / 其他”分类,说明其属于肿瘤学数据资源中的一个具体条目。

【数据内容】

依据主题标签,数据集涵盖突变数据、表达数据与免疫标志物三类信息,并以 PDX 模型为载体。源站描述中列出了“mutation expression immune markers”等字样,与主题标签相互对应,表明该资源在模型之外还包含分子层面的突变与表达信息以及免疫标志物相关内容。数据集中还出现“N/A”字样,说明源站对某一字段未给出具体取值。除上述内容外,数据集的具体样本数量、基因数量、标志物种类等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中标注提供方为 EMBL-EBI。资源与 PDMR 数据门户相关联,源站给出了指向 PDMR 样本页面(样本编号 11242)的链接,以及 PDMR 数据申请页面的链接。数据集名称中的 PDMR 与 PDX 字样表明其属于患者来源模型与数据资源体系。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与内容,该数据集可用于肛门鳞状细胞癌相关的肿瘤研究,例如围绕 PDX 模型开展的药物反应或模型特征研究,以及结合突变数据、表达数据与免疫标志物进行的分子特征分析。由于资源与 PDMR 数据门户关联,也适用于需要通过该门户申请获取数据的研究场景。具体适用场景的边界与限制,源站未提供。

【使用方法】

源站描述中给出了 PDMR 数据申请页面链接,表明数据获取需通过该申请渠道进行;同时提供了样本页面链接,可用于查看该样本的登记信息。关于数据格式、下载方式、分析流程等,源站未提供。

【质量与限制】

源站描述中部分字段取值为“N/A”,说明相应信息缺失。数据集的样本规模、数据完整性、质控指标等,源站未提供。使用时应以源站登记信息与申请渠道获取的说明为准。

【引用与许可】

源站描述中未给出引用格式与许可条款,源站未提供。数据集来源标注为 EMBL-EBI,相关使用条件需参照源站及 PDMR 数据申请页面的规定。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO5665

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

S-CMO5665 355891-322-R [PDMR] [PDX] [355891-322-R] Anal Squamous Cell Carcinoma PDX Anal Squamous Cell Carcinoma N/A mutation expression immune markers Yes https://pdmdb.cancer.gov/pls/apex/f?p=101:4:0::NO:4:P4_SPECIMENSEQNBR:11242 https://pdmr.cancer.gov/request/default.htm No EMBL-EBI https://www

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