CHOP PDX COG-N-480x 肾上腺神经母细胞瘤
(CHOP)男性 未提供 欧洲白人 原发性神经系统癌症 未收集 Stage 4 肾上腺 骨髓 nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 皮下(原为静脉尾静脉)异位 骨髓穿刺液,外周血 新鲜 0 指纹图谱
![[CHOP] [PDX] [COG-N-480x] Adrenal Gland Neuroblastoma](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/105357.jpg)
基本信息
资源简介
CHOP PDX COG-N-480x 肾上腺神经母细胞瘤
(CHOP)男性 未提供 欧洲白人 原发性神经系统癌症 未收集 Stage 4 肾上腺 骨髓 nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 皮下(原为静脉尾静脉)异位 骨髓穿刺液,外周血 新鲜 0 指纹图谱
【数据集背景】
该数据集英文名称为 [CHOP] [PDX] [COG-N-480x] Adrenal Gland Neuroblastoma,来源于 ebi.ac.uk,本站分类为肿瘤 / 其他。从名称与源站描述看,该数据集围绕肾上腺神经母细胞瘤展开,涉及患者来源异种移植模型(PDX)相关材料,并带有 COG-N-480x 这一标识。源站描述中同时出现原发性神经系统癌症、Stage 4、肾上腺、骨髓等关键词,提示该数据集与一例已发生远处转移的肾上腺神经母细胞瘤相关。整体上,该数据集属于肿瘤学与转化医学研究领域,可用于理解该特定模型的来源背景、样本类型及基本临床与实验属性。
【数据内容】
数据内容涉及一例男性、欧洲白人来源的肾上腺神经母细胞瘤相关材料。源站描述标明为原发性神经系统癌症,分期为 Stage 4,原发部位为肾上腺,并涉及骨髓。样本材料包括骨髓穿刺液和外周血,状态为新鲜。该数据集还包含异种移植相关宿主信息,宿主为 nsg 小鼠,具体品系为 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ。移植方式记录为皮下,并注明最初为静脉尾静脉接种,属于异位移植。此外,源站描述中出现“0”与“指纹图谱”字样,提示可能涉及指纹图谱相关记录,但具体含义源站未提供。除上述内容外,数据集中是否包含基因组、转录组、药物反应或其他组学数据,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述显示,样本与一例男性、欧洲白人、原发性神经系统癌症、Stage 4、肾上腺、骨髓相关的病例有关。部分字段标注为“未提供”或“未收集”,例如具体年龄、既往治疗、样本采集时间、伦理审批信息等,源站未提供。样本类型包括骨髓穿刺液和外周血,状态为新鲜。异种移植宿主为 nsg 小鼠,品系为 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ,接种方式为皮下,最初采用静脉尾静脉途径,属于异位移植。关于采集地点、采集机构、采集时间窗口及具体操作流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与肾上腺神经母细胞瘤相关的临床前研究、患者来源异种移植模型研究以及肿瘤转移研究。由于涉及 Stage 4、肾上腺原发和骨髓相关样本,可用于探索该疾病在晚期阶段的模型特征。骨髓穿刺液和外周血样本可用于循环肿瘤细胞、骨髓微转移或血液相关生物标志物的研究。nsg 宿主与皮下异位移植信息可用于异种移植建模、肿瘤生长评估及治疗响应测试等场景。指纹图谱相关记录可能用于样本身份确认或模型质控。但具体适用场景需结合源站提供的原始数据与实验设计,源站未提供完整的适用建议。
【使用方法】
使用该数据集时,应依据源站 ebi.ac.uk 提供的访问方式获取数据。由于样本涉及新鲜骨髓穿刺液和外周血,以及 nsg 小鼠异种移植模型,使用者需遵循相应的生物样本与动物实验规范。对于异种移植相关数据,应关注宿主品系 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ、皮下异位接种及最初静脉尾静脉接种等实验条件,以保证分析的可比性。若涉及指纹图谱数据,可用于样本身份核对。关于数据下载格式、文件结构、配套分析工具、预处理步骤及具体使用协议,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集存在若干限制。源站描述中多个字段标注为“未提供”或“未收集”,例如年龄、具体临床治疗信息、样本采集时间等,可能影响对病例背景的完整理解。样本量、重复数、测序深度、数据完整性指标及质控结果,源站未提供。该模型为患者来源异种移植,宿主为免疫缺陷 nsg 小鼠,移植方式为皮下异位,最初为静脉尾静脉接种,这些条件可能影响肿瘤微环境与临床实际的一致性。骨髓穿刺液和外周血为新鲜样本,其保存与处理条件可能影响后续分析,但具体条件源站未提供。指纹图谱相关记录的具体质量与用途,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,引用方式应遵循源站要求。关于许可类型、使用限制、商业使用条件、再分发要求及具体引用格式,源站未提供。使用者在发表成果或进行二次分析时,应直接查阅源站页面获取准确的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO9292
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
(CHOP) male Not Provided European White Primary Nervous System Cancer not collected Stage 4 adrenal gland bone marrow nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ Subcutaneous (originally Intravenous Tail Vein) Heterotopic Bone Marrow Aspirates,peripheral Blood Fresh 0 Fingerprinting
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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