CHOP PDX COG-N-471x 肾上腺神经母细胞瘤
(CHOP)女性 未提供 南亚或西班牙裔 亚裔 复发性神经系统肿瘤 未采集 Stage 4 肾上腺 尸检 血液 nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 皮下 异位 外周血 新鲜 0 指纹图谱,已验证 人类 高度一致
![[CHOP] [PDX] [COG-N-471x] Adrenal Gland Neuroblastoma](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/79372.jpg)
基本信息
资源简介
CHOP PDX COG-N-471x 肾上腺神经母细胞瘤
(CHOP)女性 未提供 南亚或西班牙裔 亚裔 复发性神经系统肿瘤 未采集 Stage 4 肾上腺 尸检 血液 nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ 皮下 异位 外周血 新鲜 0 指纹图谱,已验证 人类 高度一致
【数据集背景】
该数据集为肾上腺神经母细胞瘤相关研究资源,来源于公共生物数据平台,分类归属于肿瘤及其他肿瘤相关类别。神经母细胞瘤是儿童期常见的颅外实体肿瘤之一,可起源于肾上腺髓质等交感神经系统部位。本数据集所对应的样本具有复发性神经系统肿瘤的背景,且分期为Stage 4,提示属于高风险或晚期病例。样本提供方标记为CHOP,模型编号为COG-N-471x,整体以患者来源异种移植模型的形式呈现,可用于后续肿瘤生物学及转化医学研究。源站未提供更详细的研究项目背景或伦理审批信息。
【数据内容】
该数据集的核心内容为患者来源异种移植模型,英文名称为[CHOP] [PDX] [COG-N-471x] Adrenal Gland Neuroblastoma。样本涉及肾上腺部位,肿瘤类型为神经母细胞瘤,并标注为复发性神经系统肿瘤。模型编号COG-N-471x用于标识该特定PDX资源。数据中记录了样本的性别为女性,种族背景涉及南亚或西班牙裔以及亚裔。疾病分期为Stage 4。样本采集方式为尸检,样本类型为血液,状态为新鲜。移植宿主为NSG小鼠,具体品系为NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ。移植途径为皮下异位移植。源站未提供具体的分子分型、基因突变谱、表达谱或药物敏感性数据。
【采集与来源】
该数据来源于ebi.ac.uk,原始描述中标注了样本提供机构缩写CHOP。样本采集自一名女性患者,种族背景记录为南亚或西班牙裔及亚裔,疾病为复发性神经系统肿瘤,分期为Stage 4,原发部位为肾上腺。采集方式为尸检,采集样本为外周血,样本状态为新鲜。随后该样本被移植至NSG小鼠体内,小鼠品系为NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ,移植方式为皮下异位移植。源站未提供具体的采集时间、地点、患者年龄、治疗史或随访信息。
【适用场景】
该数据集适用于神经母细胞瘤特别是肾上腺来源、Stage 4、复发性神经系统肿瘤的临床前研究。由于其为患者来源异种移植模型,可用于研究肿瘤异质性、疾病进展机制以及潜在治疗靶点。皮下异位移植于NSG小鼠的模型常用于评估肿瘤生长动力学及药物反应。血液来源的新鲜样本可能适用于循环肿瘤细胞或液体活检相关探索。此外,该模型也可用于比较不同种族背景或性别相关的肿瘤生物学差异。源站未提供该数据集在具体研究项目中的使用案例或已验证的应用方向。
【使用方法】
该数据集以患者来源异种移植模型形式提供,移植宿主为NSG小鼠,移植途径为皮下异位。使用者可根据研究需要,对该PDX模型进行传代、扩增或开展药物干预实验。样本来源为新鲜外周血,采集方式为尸检,使用时应遵循相应的生物安全规范及动物实验伦理要求。由于涉及人类来源样本,使用前需确认是否符合当地法规及机构审查要求。源站未提供具体的操作步骤、培养条件、给药方案或数据分析流程。
【质量与限制】
该数据集标注了指纹图谱和已验证状态,并注明人类样本具有高度一致性。这表明模型在种属鉴定和身份确认方面经过了验证,降低了交叉污染或错误标记的风险。然而,该数据集也存在一定限制。首先,样本采集方式为尸检,可能影响样本中细胞活性或分子特征的完整性。其次,样本类型为血液,而非直接来自肾上腺肿瘤组织,可能无法完全代表原发肿瘤的异质性。此外,移植模型经过小鼠体内传代,可能发生遗传或表观遗传改变,与原发肿瘤存在差异。源站未提供具体的质控指标、测序深度、突变等位基因频率或模型稳定性数据。
【引用与许可】
该数据集来源于ebi.ac.uk,具体引用方式、许可条款及数据使用协议源站未提供。使用者应参考源站页面获取最新的引用要求、许可信息及数据共享政策。在未获得明确许可前,不应将该数据集用于商业目的或二次分发。源站未提供作者列表、发表文献或数据版本号。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO9287
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
(CHOP) female Not Provided South Asian Or Hispanic Asian Recurrent Nervous System Cancer not collected Stage 4 adrenal gland post mortem blood nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ Subcutaneous Heterotopic Peripheral Blood Fresh 0 Fingerprinting, Validated Human high concordance
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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