cBioPortal：肝内胆管癌（JHU，Nat Genet 2013）

资源简介

cBioPortal：肝内胆管癌（JHU，Nat Genet 2013）

Intrahepatic Cholangiocarcinoma (JHU, Nat Genet 2013) 是 cBioPortal 上的一个肿瘤基因组数据集，核心内容为 32 例肝内胆管癌病例和 8 例胆囊癌病例的肿瘤/正常配对样本外显子组测序。

【数据集背景】

该数据集在源站上的标题为 Intrahepatic Cholangiocarcinoma (JHU, Nat Genet 2013)，英文名称与标题一致。标题中包含 JHU 与 Nat Genet 2013 字样，并在来源信息中给出 pmid:24185509 这一文献标识。在站点的分类体系中，它被归入肿瘤 / 其他类别，并带有 chol 主题标签，便于在胆管癌相关主题下检索。除这些基本信息外，关于研究机构、研究队列、课题设计、发表期刊卷期、作者列表等背景细节，源站未提供。

【数据内容】

数据内容以肿瘤/正常配对样本的外显子组测序为主。来源站说明，该数据集包含来自 32 例肝内胆管癌病例和 8 例胆囊癌病例的肿瘤/正常配对样本的外显子组测序。也就是说，除肝内胆管癌外，还同时涉及胆囊癌样本。关于具体的突变列表、拷贝数变异、表达谱、融合基因、临床注释、生存随访、治疗信息、病理分级、分期、样本类型细目、测序深度、覆盖度、变异注释版本等，源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 cbioportal.org。来源站给出的说明为：Exome sequencing of tumor/normal pairs from 32 intrahepatic cholangiocarcinoma cases and 8 gall bladder carcinoma cases. 中文含义为，对 32 例肝内胆管癌病例和 8 例胆囊癌病例的肿瘤/正常配对样本进行外显子组测序。文献标识为 pmid:24185509。关于样本采集地点、机构伦理审批、知情同意、核酸提取方法、文库构建、外显子捕获平台、测序平台、读长、测序深度、比对流程、变异检出流程、质控标准等，源站未提供。

【适用场景】

从数据类型看，这类肿瘤/正常配对的外显子组测序资源通常可用于肿瘤基因组学的探索性分析，例如比较肿瘤与正常样本的外显子序列差异，发现候选体细胞变异，或为胆管癌、胆囊癌相关研究提供序列层面的参考。带有 chol 标签也使其适合在胆管癌主题下进行检索和整合。需要说明的是，这些属于此类数据的一般用途，并不代表源站已提供相应的分析结果或临床结论。若使用者需要明确的突变清单、临床关联、预后分析或治疗指导信息，源站未提供，不能从现有信息中直接获得。

【使用方法】

可通过 cbioportal.org 访问该数据集。关于具体的下载格式、文件清单、数据版本、是否需要账号、是否有 API 接口、是否提供在线分析工具、如何按样本或基因筛选、如何导出表格等操作细节，源站未提供。使用者应以来源站的实际页面和说明为准。

【质量与限制】

该数据集的样本规模为 32 例肝内胆管癌和 8 例胆囊癌，采用肿瘤/正常配对样本的外显子组测序。关于数据质量指标、覆盖均一性、重复样本、批次效应、样本纳入与排除标准、数据完整性、注释准确性、是否存在缺失字段等，源站未提供。由于这些信息缺失，使用者在开展二次分析前应自行核查来源站提供的说明和原始数据，避免超出数据实际支持范围作出结论。

【引用与许可】

引用该数据集或相关研究时，可使用标题 Intrahepatic Cholangiocarcinoma (JHU, Nat Genet 2013) 以及文献标识 pmid:24185509。关于许可协议、使用条款、再分发条件、商业使用限制、署名要求等，源站未提供。使用者在下载、分析、发表或共享数据前，应查阅来源站 cbioportal.org 的最新说明，并遵守相应的数据使用规范。