cBioPortal:胆管癌(ICGC,Cancer Discov 2017)
它围绕胆管癌样本展开,来源站为 cbioportal.org,并在源站描述中说明包含来自10个国家的489例胆管癌样本,采用全外显子组测序以及靶向/外显子测序

基本信息
资源简介
cBioPortal:胆管癌(ICGC,Cancer Discov 2017)
该数据集在 cBioPortal 上以“Cholangiocarcinoma (ICGC, Cancer Discov 2017)”为标题呈现,主题标签为 chol,本站分类归入“肿瘤 / 其他”。它围绕胆管癌样本展开,来源站为 cbioportal.org,并在源站描述中说明包含来自10个国家的489例胆管癌样本,采用全外显子组测序以及靶向/外显子测序。除此之外,关于其研究设计、临床注释和具体分析结果,源站未提供。
【数据集背景】
该数据集的源站标题为“Cholangiocarcinoma (ICGC, Cancer Discov 2017)”。从其名称和来源标识看,它与 ICGC 以及 Cancer Discov 2017 相关,引用标识为 pmid:28667006。该数据集在 cBioPortal 上被归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 chol。这些信息表明它属于胆管癌相关数据资源,但关于 ICGC 项目背景、Cancer Discov 2017 一文的研究目的、队列构建过程、样本筛选标准以及数据发布历史等,源站未提供。
【数据内容】
源站描述指出,该数据集包含对489例胆管癌样本进行的全外显子组测序和靶向/外显子测序,样本来自10个国家。可确定的数据内容包括胆管癌样本、测序策略为全外显子组测序和靶向/外显子测序,样本数量为489,地理来源覆盖10个国家。至于具体包含哪些基因、突变、拷贝数、表达、融合、临床变量、生存信息或其它组学层级,源站未提供。样本的病理亚型、分期、治疗信息、随访信息等,源站也未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 cbioportal.org,源站标题为“Cholangiocarcinoma (ICGC, Cancer Discov 2017)”,引用标识为 pmid:28667006。源站描述说明,其样本来自10个国家,共489例胆管癌样本,测序方式包括全外显子组测序和靶向/外显子测序。关于样本如何采集、伦理审批、知情同意、中心编号、国家分布细节、测序平台、建库方法、数据提交与整合流程等,源站未提供。
【适用场景】
根据已有信息,该数据集可被用于胆管癌相关的数据检索、浏览与探索,尤其适合关注胆管癌样本的全外显子组测序和靶向/外显子测序数据。其主题标签 chol 和“肿瘤 / 其他”分类也有助于在 cBioPortal 中按肿瘤类型定位该资源。然而,具体适用于哪些研究问题、能否用于生存分析、突变频谱分析、跨国比较、验证研究或临床决策支持等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集在 cbioportal.org 上呈现。关于访问入口、检索方式、下载格式、数据文件结构、分析工具、可视化选项、账号要求、API 调用方法、版本更新说明及操作教程等,源站未提供。因此,若需使用该数据集,应回到来源站进一步查询相关说明。
【质量与限制】
已知该数据集包含489例胆管癌样本,来自10个国家,测序策略包括全外显子组测序和靶向/外显子测序。其质量评估、样本纳入与排除标准、测序深度、覆盖均匀性、数据完整性、缺失值处理、批次效应、注释准确性、临床信息完整性及潜在偏倚等,源站未提供。该数据集被归入“肿瘤 / 其他”类别,但这是分类信息,不代表对其质量或适用性的评价。使用时应结合来源站信息自行判断。
【引用与许可】
该数据集对应的引用标识为 pmid:28667006,源站标题为“Cholangiocarcinoma (ICGC, Cancer Discov 2017)”,来源站为 cbioportal.org。关于引用格式、许可协议、使用限制、商业用途、再分发条件、隐私与伦理约束等,源站未提供。如需引用或使用,应参考来源站及 pmid:28667006 对应文献的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=chol_icgc_2017
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自10个国家的489例胆管癌样本的全外显子组测序和靶向/外显子组测序。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




