cBioPortal:胆管癌(TCGA,PanCancer Atlas)
数据为胆管癌的 TCGA PanCancer 数据,源站提供了原始数据与相关出版物的链接。该数据可用于胆管癌相关的肿瘤基因组分析,例如基于 TCGA PanCancer Atlas 的分子分型、突变谱与临床特征关联研究等(来源 cBioPortal)

基本信息
资源简介
cBioPortal:胆管癌(TCGA,PanCancer Atlas)
cBioPortal 上的 Cholangiocarcinoma (TCGA, PanCancer Atlas) 数据集聚焦于胆管癌这一肿瘤类型,属于 TCGA PanCancer Atlas 项目框架下的胆管癌数据集合。该数据集在 cBioPortal 源站以“Cholangiocarcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)”为标题发布,本站将其归入“肿瘤 / 其他”分类,主题标签为“chol”。源站说明该数据为胆管癌 TCGA PanCancer 数据,并提供了原始数据与相关出版物的链接。整体而言,该数据集可用于胆管癌相关的肿瘤基因组分析,例如基于 TCGA PanCancer Atlas 的分子分型、突变谱与临床特征关联研究等。
【数据集背景】
该数据集来源于 cbioportal.org,标题为“Cholangiocarcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)”,其定位是 TCGA PanCancer Atlas 项目中针对胆管癌的数据集合。TCGA PanCancer Atlas 是肿瘤基因组研究中被广泛使用的跨癌种资源框架,胆管癌作为其中一种肿瘤类型被纳入。源站描述指出,该数据为胆管癌 TCGA PanCancer 数据,并给出了原始数据与相关出版物的链接。数据集的主题标签为“chol”,本站分类为“肿瘤 / 其他”。关于该数据集更具体的项目发起背景、组织方式与历史沿革,源站未提供。
【数据内容】
依据源站描述,该数据集的内容为胆管癌的 TCGA PanCancer 数据。源站同时提供了原始数据与相关出版物的链接,说明该数据集在 cBioPortal 上以整合形式呈现,并指向其原始出处与文献依据。数据集的主题标签为“chol”,本站分类为“肿瘤 / 其他”。关于数据所包含的具体样本数量、组学层次、突变基因列表、临床字段、分子分型结果等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 cbioportal.org,源站标题为“Cholangiocarcinoma (TCGA, PanCancer Atlas)”。源站描述明确说明该数据为胆管癌 TCGA PanCancer 数据,并指出原始数据与相关出版物可通过链接获取。数据集涉及的 DOI 信息以 pmid 形式列出,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296。关于样本采集的具体机构、时间范围、伦理审批与处理流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于胆管癌相关的肿瘤基因组分析。例如,可基于 TCGA PanCancer Atlas 开展分子分型、突变谱与临床特征关联研究等。由于该数据集属于 TCGA PanCancer Atlas 框架下的胆管癌数据,其潜在用途还包括在跨癌种比较研究中作为胆管癌的代表性数据集合。关于该数据集在其他具体研究方向上的适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集发布在 cBioPortal 源站,用户可通过源站访问该数据集,并借助源站提供的原始数据与相关出版物链接获取更多信息。源站描述中给出了原始数据与出版物的链接入口。关于具体的下载方式、API 调用方法、数据格式说明与可视化操作步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 TCGA PanCancer Atlas 项目下的胆管癌数据,源站提供了原始数据与相关出版物的链接,便于使用者追溯数据出处与文献依据。关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、批次效应、样本量限制以及使用时的注意事项,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集涉及的 DOI 信息以 pmid 形式列出,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296。源站描述指出相关出版物可通过链接获取。关于该数据集的具体许可条款、使用限制与引用格式要求,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=chol_tcga_pan_can_atlas_2018
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Cholangiocarcinoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




