吸烟调控鼻腔与支气管气道中表达SARS-CoV-2进入基因的不同分泌亚群
该单细胞数据集来自 CZ CELLxGENE,包含支气管与鼻腔两部分样本。支气管样本取自因疑似肺癌接受诊断性支气管镜检查者的主支气管刷取细胞;鼻腔样本取自接受肺癌筛查的不确定肺结节患者的下鼻甲

基本信息
资源简介
吸烟调控鼻腔与支气管气道中表达SARS-CoV-2进入基因的不同分泌亚群
该单细胞数据集来自 CZ CELLxGENE,包含支气管与鼻腔两部分样本。支气管样本取自因疑似肺癌接受诊断性支气管镜检查者的主支气管刷取细胞;鼻腔样本取自接受肺癌筛查的不确定肺结节患者的下鼻甲。疾病状态为 normal,组织涵盖支气管黏膜与鼻腔上皮,检测平台为 10x 3' v2 与 CEL-seq2。数据可用于研究吸烟如何调控鼻腔与支气管气道中表达 SARS-CoV-2 进入基因的不同分泌细胞亚群,并支持呼吸道细胞组成与基因表达的比较分析(来源 cellxgene.cziscience.com)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):对于支气管数据集,细胞来自主支气管的刷取,作为一项涉及在 Boston Medical Center 接受疑似肺癌诊断性支气管镜检查的参与者的研究的一部分。对于鼻腔数据集,细胞来自鼻下鼻甲,作为一项涉及在 Boston Medical Center 和 Lahey Hospital Medical Center 接受肺癌筛查的不确定肺结节参与者的研究的一部分。疾病:normal。组织:支气管黏膜、鼻腔上皮。检测:10x 3' v2、CEL-seq2。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
【主题与分类】
主题标签:normal。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://cellxgene.cziscience.com/collections/af500bec-a5d6-4569-9f50-4314f2e7a011
下载信息
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数据集获取
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对于支气管数据集,细胞来自主支气管的刷检,这是一项涉及在波士顿医疗中心因疑似肺癌接受诊断性支气管镜检查的参与者的研究的一部分。对于鼻腔数据集,细胞来自鼻下鼻甲,这是一项涉及在波士顿医疗中心和莱希医院医疗中心接受肺癌筛查的不确定性肺结节参与者的研究的一部分。疾病:正常。组织:支气管黏膜、鼻腔上皮。检测方法:10x 3’ v2、CEL-seq2。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




