肝癌

肝癌即原发性肝细胞癌，是起源于肝细胞的恶性上皮性肿瘤，在全球恶性肿瘤中发病率与死亡率均居前列。其主要危险因素包括乙型或丙型肝炎病毒感染、酒精性肝病、黄曲霉毒素暴露及代谢相关脂肪性肝病。起病隐匿，早期常无症状，中晚期可出现肝区疼痛、消瘦、黄疸、腹水等表现。诊断依赖血清甲胎蛋白检测、增强CT或MRI等影像学检查，必要时行肝穿刺活检。治疗策略涵盖手术切除、肝移植、局部消融、经导管动脉化疗栓塞、靶向治疗及免疫治疗，需根据肿瘤分期与肝功能状况个体化决策。该病是专病数据库、真实世界研究与精准医学的重要方向，尤其关注早期筛查标志物和耐药机制探索。

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共 855 个数据集

PRJNA193344：人肝细胞癌基因表达谱（训练集1）

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，收录 87 份组织样本的基因表达谱，包括 48 份原发性肝细胞癌样本和 39 份非癌组织，来自 61 位患者；其中肝癌组织来自 16 位年轻肝细胞癌患者和 32 位老年肝细胞癌患者

PRJNA545709：发育中小鼠肝脏时间分辨多组学图谱

时间序列Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，包含小鼠肝脏从胚胎期 E12.5 到出生后 W8 的蛋白质、mRNA 和转录因子 DNA 结合活性等多维组学测量，覆盖肝脏发育主要阶段

PRJNA638818：LncRNA SNHG17 促进肝癌增殖、迁移及不良预后

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，聚焦肝细胞癌（HCC）中长链非编码 RNA SNHG17 的表达模式与生物学功能。源站描述显示，研究结合生物信息学分析、qRT-PCR、敲低与过表达实验及 RNA 测序，并利用公开的 TCGA-LIHC 与 GSE102079 数据，发现 SNHG17 在 HCC 组织与细胞

PRJNA691340：XBP1s与LEF1协同促进肝细胞癌发展

基因组Other

该数据集来自NCBI，包含在HepG2细胞中开展的RNA-seq与ChIP-seq分析，用于解析XBP1s在肝细胞癌细胞中的分子机制

Huh7与HLF肝癌细胞2D和3D培养条件下的转录组图谱

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集包含Huh7和HLF两种人肝癌细胞系在2D单层、3D Inject-Embed和3D Mix-Embed培养条件下的RNA-seq数据，每种条件设两个生物学重复

PRJNA523341：人肝类器官——用于HBV感染、复制及相关肝细胞癌的患者来源原代模型

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，包含HBV感染患者来源与健康供体来源肝类器官的总RNA转录组数据，用于探究人肝类器官作为HBV感染及相关肿瘤发生建模平台的潜力

PRJNA834137：小鼠HCC模型中FAD亚型鉴定

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，聚焦小鼠肝细胞癌（HCC）模型中基于42个脂肪酸降解（FAD）基因的分子分型。数据整合了5个公开数据集的90个样本（涵盖11个小鼠HCC模型），并纳入研究者自建NRAS.MYC.ND与AKT1.MYC.KD两个模型的8个样本转录组测序数据，旨在探索这两个模型的转录组特征，可用于

PRJNA754099：与肿瘤肝细胞分化相关的七个基因最小子集可预测人肝细胞癌的不良预后

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/肝癌分类，主题为转录组或基因表达。源站描述了一项整合转录组学分析，利用 HepaRG 细胞系模型定义反映肿瘤肝细胞分化状态的基因表达特征，并据此将 HCC 患者分层为临床相关分子亚型，进而识别出由 7 个分化相关基因组成的最小子集，用于在多个癌症数据集中预测不良预后

PRJNA683601：Hep3B细胞中TAp73异位表达的表达数据集

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，属于肿瘤/肝癌分类，主题为转录组或基因表达。源站描述显示研究聚焦肝细胞去分化与肝细胞癌（HCC）机制，探讨p73在HCC肿瘤中的表达及转录活跃型p73（TAp73）在HCC细胞中的效应

PRJNA816189：剪切波弹性成像测肝肿瘤硬度预测抗PD-1联合仑伐替尼治疗HCC进展

基因组预测Raw sequence reads

该数据集来自NCBI，主题为肿瘤/肝癌，包含原始序列读取数据。源站描述了一项回顾性研究，评估133例接受抗PD-1抗体联合仑伐替尼治疗的晚期肝细胞癌患者，在治疗前通过剪切波弹性成像测量基线肝硬度，并利用单因素和多因素logistic回归构建列线图，结合RNA测序和免疫组化染色分析肿瘤硬度相关的生物学

PRJNA794275：人类转录组或基因表达数据（肝癌）

医学影像预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/肝癌分类，主题为转录组或基因表达。源站描述显示，研究纳入 60 例 Edmondson-Steiner II 级肝细胞癌患者，治疗前进行 FDG PET/CT 扫描，并对肿瘤与正常肝组织进行 RNA 测序，通过 Pearson 相关分析探索代谢相关基因与肿瘤 FDG

PRJNA875910：MTFR2 在肝细胞癌中塑造免疫微环境屏障

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，围绕线粒体分裂调节因子 2（MTFR2）在肝细胞癌（HCC）中的作用，整合了八种 HCC 细胞系的 MTFR2 分析结果，以及来源于 HCC 组织 bulk 数据的三个数据集（公共数据集、真实世界数据集、免疫治疗数据集）及生存与免疫治疗数据