PLANET 亚太网络肝癌精准医学——HCC 复发队列
肝细胞癌(HCC)是一种高度致命的癌症,以显著的肿瘤内异质性(ITH)为特征。鉴于 50% 至 70% 的 HCC 患者会经历复发,理解复发的起源与进展至关重要

基本信息
资源简介
PLANET 亚太网络肝癌精准医学——HCC 复发队列
PLANET-HCC 复发队列(The Precision Medicine in Liver Cancer across an Asia-pacific NETwork (PLANET) - HCC recurrence cohort)是一个聚焦肝细胞癌复发问题的多部门协作配对队列数据集,来源于 synapse.org,在分类上归属于肿瘤 / 肝癌方向。该数据集围绕肝细胞癌(HCC)这一高度致命、以显著肿瘤内异质性(ITH)为特征的癌症展开,针对 50% 至 70% 的 HCC 患者会经历复发这一临床现实,试图通过纵向追踪的方式理解复发的起源与进展。数据集共纳入 24 名患者,配套提供全面的全基因组测序与转录组样本,旨在追溯复发来源并识别与早期复发相关的分子特征,从而为改进早期 HCC 复发的预测以及潜在治疗策略的制定提供依据。
【数据集背景】
肝细胞癌(HCC)是一种高度致命的癌症,以显著的肿瘤内异质性(ITH)为特征。临床上,50% 至 70% 的 HCC 患者会经历复发,因此理解复发的起源与进展对于改善患者管理至关重要。正是基于这一背景,相关研究组建了覆盖多部门、以配对方式设计的 HCC 复发队列,希望通过纵向随访与多组学数据结合的方式,回答复发从何而来、如何进展这一核心问题,并进一步识别与早期复发相关的分子特征。
【数据内容】
该数据集纳入 24 名患者的配对样本,涵盖全面的全基因组测序(whole genome sequencing)与转录组(transcriptome)样本。所谓“配对”,对应的是同一患者原发与复发样本之间的对应关系,使得研究者能够在个体内部比较肿瘤的分子变化。数据集的核心目标是通过这一纵向队列追溯复发的起源,并识别与早期复发相关的分子特征。除上述样本类型与患者数量外,源站未提供更细化的数据字段、文件格式或样本数量说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 synapse.org,属于 PLANET(The Precision Medicine in Liver Cancer across an Asia-pacific NETwork)框架下的 HCC 复发队列。其设计特点是多部门(multi-sector)协作与配对(paired)采样相结合,并以纵向(longitudinal)队列的形式组织样本与数据。关于具体的采集机构、采集时间、随访周期与伦理审批信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其数据构成,该数据集适用于围绕 HCC 复发展开的研究场景,包括:追溯肿瘤复发的起源、刻画复发过程中的肿瘤内异质性变化、识别与早期复发相关的分子特征,以及在此基础上探索改进早期 HCC 复发预测的方法和潜在治疗策略。由于同时具备全基因组测序与转录组数据,也可用于在基因组与转录组层面联合考察复发相关分子事件。源站未提供关于其他具体应用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供关于数据访问方式、下载流程、文件组织格式、配套分析工具或使用协议的具体说明。使用者需依据 synapse.org 平台上的数据集页面获取进一步的操作指引。
【质量与限制】
该队列的样本量为 24 名患者,属于规模较小的配对纵向队列,其设计侧重于对复发起源与早期复发分子特征的深入刻画。源站未提供关于数据质量评估、缺失情况、批次效应或验证结果的具体信息,也未说明该队列在人群代表性方面的限制。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款的具体信息。使用该数据集前,应前往 synapse.org 上的对应页面确认引用要求与使用许可。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://synapse.org/Synapse:syn63940913
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
肝细胞癌(HCC)是一种高度致命的癌症,以显著的瘤内异质性(ITH)为特征。鉴于50%至70%的HCC患者会经历复发,理解复发的起源和进展至关重要。为此,我们组建了一个包含24名患者的多区域配对HCC复发队列,包括全面的全基因组测序和转录组样本。通过这一纵向队列,我们旨在追溯复发的起源并识别与早期复发相关的分子特征。这些见解可能改善对早期HCC复发的预测,并为潜在的治疗策略提供依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。



![环形肉芽肿治疗及托法替尼对促炎细胞因子活性的抑制 [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/13466.jpg)
