对照与blf-/-;drl 4KO斑马鱼胚胎造血祖细胞转录组测序分析

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE202193,对对照与blf-/-;drl 4KO斑马鱼胚胎的造血祖细胞进行二代测序转录组分析

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基因组预测GPL249957955
GSE202193: Transcriptome analysis on hematopoietic progenitor cell from control and blf-/-;drl 4KO zebrafish embryo by Next Generation Sequencing

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

对照与blf-/-;drl 4KO斑马鱼胚胎造血祖细胞转录组测序分析

Transcriptome analysis on hematopoietic progenitor cell from control and blf-/-;drl 4KO zebrafish embryo by Next Generation Sequencing

该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE202193,对对照与blf-/-;drl 4KO斑马鱼胚胎的造血祖细胞进行二代测序转录组分析。研究利用blf基因捕获等位基因的RFP表达作为谱系示踪,通过FACS分选造血祖细胞并采用低起始量RNA-seq,旨在确定blf和drl簇基因缺失如何改变转录组景观。数据含1个文件(GSE202193_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL24995平台与物种7955,本站归类为肿瘤/白血病,可用于研究胚胎造血扰动与白血病等疾病相关的转录组变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胚胎造血过程中的扰动可能导致从胎儿贫血到白血病等一系列疾病。我们发现斑马鱼胚胎中的造血受blf和drl簇基因协同调控。为了确定blf和drl簇基因缺失如何改变转录组景观,利用blf基因捕获等位基因的RFP表达作为谱系示踪,通过FACS收集造血祖细胞,并应用低起始量RNA-seq。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24995、7955。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE202193

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 08 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胚胎造血过程中的扰动可能导致从胎儿贫血到白血病的疾病。我们发现斑马鱼胚胎中的造血作用受blf和drl簇基因的协同调控。为了确定blf和drl簇基因缺失如何改变转录组景观,利用blf基因捕获等位基因的RFP表达作为谱系示踪,通过FACS收集造血祖细胞,并应用了低起始量RNA-seq。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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