跨脑室和年龄的脉络丛细胞和空间图谱

该数据集是一个基于单细胞和单核测序的脉络丛细胞和空间图谱,包含小鼠胚胎期、成年期和衰老期各脑室(侧脑室、第三脑室和第四脑室)的基因表达数据,模态涉及单细胞RNA测序、空间成像(smFISH和共聚焦)及蛋白质表达验证,主要用于研究脉络丛的血脑脊液屏障功能、细胞多样性、区域化基因表达以及年龄相关的转录组变化,为神经发育、衰老和脑屏障疾病(如脉络丛癌)的机制探索提供关键数据支持。

Broad Institute of MIT and Harvard
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
神经科学基因表达
创建时间2022-02-20
更新时间2022-02-20
原始链接

http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c111a1621f0d7c29e004d20eda844f6d

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资源简介

该数据集是一个关于脉络丛(Choroid Plexus, ChP)的单细胞和单核测序图谱,覆盖了小鼠脑的各个脑室(侧脑室、第三脑室和第四脑室)以及不同发育阶段(胚胎期E16.5、成年期4个月和衰老期20个月)。数据集包含单细胞测序数据(15,620个细胞)和单核测序数据(83,040个细胞),通过smFISH、免疫组化和共聚焦成像等技术进行了空间定位和验证。数据揭示了脉络丛的细胞类型、亚型、增殖细胞、祖细胞群体以及区域化基因表达,并展示了从发育到衰老过程中上皮细胞和间充质细胞的转录组变化,特别是衰老过程中上皮细胞的宿主防御程序上调和巨噬细胞IL-1b信号基因的表达增强。该数据集主要用于研究脉络丛的血脑脊液屏障功能、细胞多样性、空间结构以及年龄相关的分子变化,为神经发育、衰老和脑屏障相关疾病(如脉络丛癌)的研究提供资源。

提供机构:Broad Institute of MIT and Harvard

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影像A cellular and spatial map of the choroid plexus across brain ventricles and ages