PXD007580：人血浆蛋白质的鸟枪法蛋白质组学鉴定
本研究基于MS1与MS2数据分析，使用粗制未标记合成（CUS）肽以确保记录其MS2谱，并通过SRM方法验证蛋白质鉴定。结合鸟枪法、自下而上蛋白质组学、掺入肽策略及Q Exactive，对人血浆进行蛋白质鉴定
基本信息
资源简介
PXD007580：人血浆蛋白质的鸟枪法蛋白质组学鉴定
本研究基于MS1与MS2数据分析，使用粗制未标记合成（CUS）肽以确保记录其MS2谱，并通过SRM方法验证蛋白质鉴定。结合鸟枪法、自下而上蛋白质组学、掺入肽策略及Q Exactive，对人血浆进行蛋白质鉴定。经搜索和选择反应监测验证，共鉴定出17种人血浆蛋白质，对应所用19种CUS肽中的17种（来源 ebi.ac.uk）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究聚焦于基于MS1和MS2数据分析的人血浆蛋白质鉴定，使用粗制未标记合成（CUS）肽以确保其MS2谱图的记录，并随后通过SRM方法验证蛋白质鉴定结果。所进行的搜索以及随后通过选择反应监测方法对蛋白质鉴定结果的验证，在人血浆中鉴定出17种蛋白质，对应所用19条CUS肽中的17条。
【主题与分类】
主题标签：Shotgun proteomics、Mass spectrometry、Bottom-up proteomics、Spike-in peptides、Human plasma、Protein identification。本站分类：肿瘤/癌症（总论）。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007580
下载信息
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究聚焦于基于MS1和MS2数据分析的人血浆蛋白质鉴定，使用粗制未标记合成（CUS）肽以确保其MS2谱图的记录，并随后通过SRM方法验证蛋白质鉴定结果。所进行的搜索以及随后通过选择反应监测方法对蛋白质鉴定结果的验证，在人血浆中鉴定出17种蛋白质，对应所用19条CUS肽中的17条。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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