乳腺癌
乳腺癌是发生于乳腺导管或小叶上皮细胞的恶性肿瘤，常见病理类型包括浸润性导管癌和小叶癌。其发病与遗传因素（如BRCA1/2突变）、激素暴露、生活方式等多种内外源因素相关。典型临床表现包括乳房无痛性肿块、乳头溢液、皮肤橘皮样改变及腋窝淋巴结肿大。诊断主要依靠乳腺X线摄影、超声、MRI及空芯针穿刺活检，并通过免疫组化检测ER、PR、HER2表达指导分型与治疗。治疗策略整合手术、放射治疗、化疗、内分泌治疗及靶向治疗，强调基于分子亚型的个体化综合管理。乳腺癌已成为精准医学与真实世界研究的重点病种，全球疾病负担持续上升，早期筛查与全程管理显著改善患者预后。
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已知功能性同源重组状态的乳腺癌队列全基因组测序
该数据集来自 omicsdi.org，为乳腺癌队列的全基因组测序数据，并标注了已知的功能性同源重组状态。源站描述围绕 PARP 抑制剂与双链断裂诱导化疗的患者筛选问题，介绍了基于新鲜原发乳腺癌组织体外照射后增殖细胞中 RAD51 焦点形成的 RECAP 功能检测，以及基于拷贝数数据基因组模式的 BR
浸润性TAM亚群与一般TAM群体的比较
该数据集来自 NCBI GEO（GSE18295），主题为浸润性肿瘤相关巨噬细胞（TAM）亚群与一般 TAM 群体的转录组比较，属于肿瘤/乳腺癌方向，采用表达谱芯片平台 GPL9298，物种为小鼠（10090）
BRCA1和BRCA2突变携带者正常乳腺与卵巢上皮细胞基因表达改变
该数据集来自NCBI，包含BRCA1和BRCA2突变携带者及对照的原代乳腺与卵巢上皮细胞转录组表达谱芯片数据，文件为GSE19383_series_matrix.txt.gz
BRCA2顺式调控对正常乳腺及BRCA2突变携带者癌症风险的影响（表达数据）
该数据集来自NCBI GEO，聚焦BRCA2基因顺式调控对正常乳腺组织及BRCA2突变携带者癌症风险的影响，包含1个表达谱芯片数据文件（GSE32124_series_matrix.txt.gz），平台为GPL6947，物种为人类（9606）
小鼠乳腺癌外显子水平转录组分析揭示不同转移能力肿瘤的特异性剪接变化
该数据集来自 NCBI GEO（GSE21994），为小鼠乳腺癌外显子水平转录组表达谱芯片数据，包含 1 个系列矩阵文件
GSE29738：通过转录组测序鉴定等位基因特异性可变mRNA加工
该数据集来自NCBI GEO，标题为通过转录组测序鉴定等位基因特异性可变mRNA加工，属于肿瘤/乳腺癌分类。源站描述介绍了一种名为ASARP的方法，利用RNA-Seq数据在单核苷酸和全基因/异构体水平识别等位基因特异性表达及mRNA加工调控事件，并应用于人胶质母细胞瘤细胞系U87MG和原发性乳腺癌组
乳腺癌细胞系表达数据
该数据集来自 NCBI GEO（GSE41313），收录 51 株分子特征明确的人乳腺癌细胞系的 miRNA 表达谱，使用 Exiqon LNA 修饰寡核苷酸捕获探针微阵列检测 725 个人类 miRNA
GSE77308：乳腺癌细胞中CSL缺失解锁缺氧反应并增强肿瘤生长潜力
数据对应乳腺癌细胞中 CSL 缺失相关研究，可用于分析 CSL 缺失引起的转录组变化、缺氧反应及肿瘤生长潜力相关基因表达模式（来源 NCBI）
GSE62966：等位基因特异性表达及其染色质状态分析以识别逃逸X染色体失活的基因
该数据集来自NCBI GEO，聚焦乳腺癌中失活X染色体的三维核组织异常与异染色质状态扰动，涵盖等位基因特异性表达与染色质状态分析，用于识别逃逸X染色体失活的基因
AT1样细胞单独培养或与对照或shEphB6敲低D2.0R-EGFP细胞共培养的基因表达谱
该数据集来自NCBI GEO，包含AT1样细胞在单独培养或与对照或shEphB6敲低的D2.0R-EGFP乳腺癌细胞共培养条件下的基因表达谱，采用高通量测序进行表达谱分析
哥伦比亚女性乳腺肿瘤中祖先血统作为基因表达潜在修饰因子的数据集
该数据集来自 NCBI，聚焦哥伦比亚女性乳腺肿瘤，探讨祖先血统对基因表达的潜在修饰作用。可用于分析不同祖先成分与肿瘤基因表达差异的关联，支持乳腺癌分子分型及族群差异研究（来源 NCBI）
GSE74981：下一代测序解析RORC（RORgamma）在乳腺癌中的新功能
数据通过NEXTseq平台结合基因功能获得与缺失及药理处理进行表达谱分析，包含1个文件（GSE74981_series_matrix.txt.gz），主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL18573及物种9606
