浸润性TAM亚群与一般TAM群体的比较

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE18295

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤微环境会改变肿瘤的恶性程度。在实体瘤中，该环境内有大量巨噬细胞（肿瘤相关巨噬细胞；TAMs）浸润。在遗传学研究中，从小鼠乳腺癌模型中清除这些细胞后，已证实它们可促进肿瘤向恶性进展并增加转移潜能。机制研究表明，这些效应是通过刺激肿瘤细胞迁移、侵袭、血管内渗以及增强血管生成来实现的。利用体内侵袭实验已证明，侵袭性癌细胞是肿瘤细胞中的一个独特亚群，其侵袭和趋化依赖于TAMs的共同迁移，并通过EGF/CSF-1旁分泌环路进行 obligatory 双向信号传导。在本研究中，分离了这些促进侵袭的巨噬细胞，并将其转录组与通过流式细胞术使用既定巨噬细胞标志物不加区分地分离的功能性TAMs进行了比较分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。