单细胞多组学测序揭示乳腺癌淋巴结转移中的基因组、表观基因组和转录组动态
我们对来自七位乳腺癌患者的 589 个肿瘤细胞进行了单细胞多组学测序。样本的详细信息可在 meta.csv 中找到。主要图表的代码由 R 生成
基本信息
资源简介
单细胞多组学测序揭示乳腺癌淋巴结转移中的基因组、表观基因组和转录组动态
我们对来自七位乳腺癌患者的 589 个肿瘤细胞进行了单细胞多组学测序。样本的详细信息可在 meta.csv 中找到。主要图表的代码由 R 生成
Single-cell multi-omics sequencing reveals genomic, epigenomic and transcriptomic dynamics during lymph node metastasis in breast cancer
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集与发表于 Genomics, Proteomics and Bioinformatics 的“Single-cell multi-omics sequencing reveals genomic, epigenomic and transcriptomic dynamics during lymph node metastasis in breast cancer”相关。我们对来自七位乳腺癌患者的 589 个肿瘤细胞进行了单细胞多组学测序。样本的详细信息可在 meta.csv 中找到。主要图表的代码由 R 生成。提供了原始拷贝数、DNA 甲基化和基因表达矩阵。
【主题与分类】
主题标签：肿瘤、乳腺癌、单细胞多组学、淋巴结转移、基因组、表观基因组、转录组。本站分类：肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.19563318
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.19563318
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 79.9 MB。
数据说明
该数据集与发表于Genomics, Proteomics and Bioinformatics的“Single-cell multi-omics sequencing reveals genomic, epigenomic and transcriptomic dynamics during lymph node metastasis in breast cancer”相关。我们对来自七位乳腺癌患者的589个肿瘤细胞进行了单细胞多组学测序。样本的详细信息可在meta.csv中查阅。主图代码由R生成。提供了原始拷贝数、DNA甲基化和基因表达矩阵。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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