肿瘤缺氧与拷贝数改变负荷及亚型依赖总生存期关联的可复现性数据包

该数据包为乳腺癌研究中肿瘤缺氧与全局拷贝数改变负荷及亚型依赖总生存期关联的可复现性材料,包含R分析脚本、README、数据清单、经处理的TCGA与METABRIC生存分析数据集、CNA分析数据集、最终结果工作簿、报告估计值摘要及会话信息

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文本预测breast cancerhypoxiaTCGAMETABRICcopy number alterationsurvival analysisreproducibility
Reproducibility package for: Tumor hypoxia is associated with global copy-number alteration burden and subtype-dependent overall survival in breast cancer: evidence from TCGA and METABRIC

基本信息

模态
文本
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-19
版本
1.0

资源简介

肿瘤缺氧与拷贝数改变负荷及亚型依赖总生存期关联的可复现性数据包

Reproducibility package for: Tumor hypoxia is associated with global copy-number alteration burden and subtype-dependent overall survival in breast cancer: evidence from TCGA and METABRIC

该数据包为乳腺癌研究中肿瘤缺氧与全局拷贝数改变负荷及亚型依赖总生存期关联的可复现性材料,包含R分析脚本、README、数据清单、经处理的TCGA与METABRIC生存分析数据集、CNA分析数据集、最终结果工作簿、报告估计值摘要及会话信息。原始数据来自cBioPortal兼容格式的公共来源,可用于复现论文主要分析,支持缺氧与拷贝数改变及生存关联的验证性研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本记录包含复现题为“Tumor hypoxia is associated with global copy-number alteration burden and subtype-dependent overall survival in breast cancer: evidence from TCGA and METABRIC”的手稿中所报告主要分析所需的代码和衍生分析文件。该数据包包括主R分析脚本、README文件、数据集清单、经处理的TCGA和METABRIC生存分析数据集、经处理的CNA分析数据集、最终结果工作簿、最终报告估计值的纯文本摘要以及会话信息。原始TCGA-BRCA和METABRIC源数据以cBioPortal兼容格式从公共来源获取。本Zenodo记录提供用于支持所报告分析直接可复现性的衍生文件和分析代码。

【主题与分类】

主题标签:breast cancer、hypoxia、TCGA、METABRIC、copy number alteration、survival analysis、reproducibility。本站分类:肿瘤/乳腺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.19688814

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本记录包含重现稿件《肿瘤缺氧与乳腺癌整体拷贝数改变负荷及亚型依赖性总生存相关:来自TCGA和METABRIC的证据》中所报告主要分析所需的代码和衍生分析文件。该数据包包括主R分析脚本、README文件、数据集清单、经处理的TCGA和METABRIC生存分析数据集、经处理的CNA分析数据集、最终结果工作簿、最终报告估计值的纯文本摘要以及会话信息。原始TCGA-BRCA和METABRIC源数据以cBioPortal兼容格式从公共来源获取。本Zenodo记录提供衍生文件和分析代码,用于支持所报告分析的直接可重现性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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