PRJDB15625：Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响
由于缺乏治疗靶点，使用细胞毒性药物的化疗是三阴性乳腺癌（TNBC）的常规治疗。然而，大多数 TNBC 会对化疗产生耐药性，从而降低治疗效果
基本信息
资源简介
PRJDB15625：Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响
PRJDB15625 数据集聚焦于 Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响，属于肿瘤/乳腺癌研究方向，来源站点为 ebi.ac.uk。该数据集所对应的研究背景是：三阴性乳腺癌（TNBC）因缺乏治疗靶点，常规治疗手段为使用细胞毒性药物的化疗，但大多数 TNBC 会对化疗产生耐药性，从而降低治疗效果。研究进一步关注肿瘤微环境诱导的机制如何使体内化疗耐药性更加复杂和稳固，并旨在分析在常氧条件下激活缺氧诱导因子 1（HIF-1）的 Munc18-1 相互作用蛋白 3（Mint3）的缺失是否能使 TNBC 对化疗敏感。该数据集即为围绕这一研究目标产生的转录组数据资源，可用于考察 Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响。
【数据集背景】
三阴性乳腺癌（TNBC）由于缺乏治疗靶点，临床上通常采用细胞毒性药物进行化疗。然而，大多数 TNBC 会获得对化疗的耐药性，导致治疗效果下降。除 TNBC 中的致癌突变外，微环境诱导的机制使体内的化疗耐药性更加复杂和稳固。基于这一背景，相关研究旨在分析 Mint3（Munc18-1 相互作用蛋白 3）的缺失是否能使 TNBC 对化疗敏感；Mint3 已知可在常氧条件下激活缺氧诱导因子 1（HIF-1）。该数据集正是围绕 Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响而建立，服务于上述研究问题。
【数据内容】
该数据集英文名称为“PRJDB15625: Impact of Mint3 on transcriptome in MDA-MB-231 tumors”，其核心内容为 MDA-MB-231 肿瘤中与 Mint3 相关的转录组数据，用于评估 Mint3 对肿瘤转录组的影响。数据集所属分类为肿瘤/乳腺癌。关于样本数量、分组设计、测序平台、数据文件格式与规模等具体内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述说明了研究背景与目标，即针对 TNBC 化疗耐药问题，分析 Mint3 缺失是否使 TNBC 对化疗敏感，并在此基础上考察 Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响。关于样本采集的具体流程、实验处理细节、测序或检测方法、时间与地点等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与三阴性乳腺癌相关的转录组研究场景，尤其是围绕 MDA-MB-231 肿瘤模型中 Mint3 对转录组影响的分析。结合源站描述，其潜在应用方向包括：研究 Mint3 缺失与 TNBC 化疗敏感性之间的关系；探讨常氧条件下 HIF-1 激活相关机制在 TNBC 化疗耐药中的作用；以及从转录组层面考察肿瘤微环境诱导的化疗耐药机制。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可用于分析 Mint3 对 MDA-MB-231 肿瘤转录组的影响。使用时应结合源站描述中的研究目的，围绕 Mint3 缺失是否使 TNBC 对化疗敏感这一核心问题开展转录组层面的比较与分析。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤、分析流程与软件参数等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 ebi.ac.uk，围绕 MDA-MB-231 肿瘤中 Mint3 对转录组的影响而建立。其研究背景明确指向 TNBC 化疗耐药与 Mint3/HIF-1 相关机制。关于数据质量评估指标、样本量、批次效应、数据完整性以及使用中的具体限制，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJDB15625
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
由于缺乏治疗靶点，细胞毒性药物化疗是三阴性乳腺癌（TNBC）的常规治疗方法。然而，大多数TNBC会对化疗产生耐药性，从而降低治疗效果。除TNBC中的致癌突变外，微环境诱导的机制使体内化疗耐药性更加复杂和稳固。在此，我们旨在分析耗竭Munc18-1相互作用蛋白3（Mint3）——该蛋白在常氧条件下激活缺氧诱导因子1（HIF-1）——是否能使TNBC对化疗敏感。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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