TNBC瘤内微生物群落特征及其相关代谢物改变

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS13119

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三阴性乳腺癌（TNBC）由于缺乏治疗靶点且预后不良，对女性健康构成重大挑战。近年来，在分子病理学领域，人们越来越关注瘤内微生物群落和肿瘤细胞代谢改变的作用。然而，微生物群及其代谢物影响TNBC的确切机制仍不清楚，值得进一步研究。在本研究中，我们通过对福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）组织样本进行16S rRNA MiSeq测序，分析了不同乳腺癌亚型中的微生物群落组成。值得注意的是，与癌症应答相关的一种微生物Turicibacter在TNBC中表现出显著更高的丰度。同样，基于质谱的代谢组学分析揭示了特定代谢物的显著差异，如nutriacholic、pregnanetriol和cortol。此外，我们观察到瘤内……之间存在显著相关性

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。