三阴性乳腺癌脂质代谢研究的离体模型表征

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS13377

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

脂质代谢驱动癌症进展，但难以用常规方法建模。体内模型可提供循环脂质，但成本高且通量低；而体外模型的培养基中缺乏足够的脂质供应。在此，我们利用脂质组学分析，评估鸡胚绒毛尿囊膜（CAM）异种移植模型和组织切片模型在9天孵育期内作为三阴性乳腺癌（TNBC）脂质代谢离体癌症模型的表现。TNBC肿瘤脂质组的差异由原发性和转移性肿瘤之间的固有差异驱动，随后由离体模型驱动。来自原发性和转移性TNBC肿瘤的CAM异种移植物中，醚连接磷脂酰胆碱（PC-O）和PC脂质积累（q < 0.05），但在离体肿瘤切片中未发生变化。相反，与CAM异种移植样本相比，来自原发性和转移性TNBC模型的离体肿瘤切片中，鞘磷脂（SM）和甘油三酯（TG）脂质升高尤为明显。冷冻保存的肿瘤片段被成功复苏，在CAM-PDX模型中显示出与新植入的TNBC肿瘤片段相似的脂质组谱。总脂肪酸分析揭示了依赖离体模型的差异，提示肿瘤微环境中脂质的可用性可能影响脂肪酰基组成，但不影响酯化脂质的分布。总之，CAM异种移植和组织切片模型可作为稳健且经济有效的工具，用于研究癌症脂质代谢随时间的变化。本研究为利用离体模型表征支持TNBC肿瘤生长的独特脂质改变奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。