用于机器学习练习的TCGA乳腺癌数据
该数据集来自figshare,由Stephen Piccolo于2015年发布,基于TCGA乳腺癌临床与基因表达数据整理而成

基本信息
资源简介
用于机器学习练习的TCGA乳腺癌数据
Breast cancer data from TCGA for machine learning exercise
该数据集来自figshare,由Stephen Piccolo于2015年发布,基于TCGA乳腺癌临床与基因表达数据整理而成。作者解析临床数据确定HER2阳性患者,提取这些患者的基因表达数据并构建无缺失值的基因表达矩阵,矩阵首行标注HER2状态(1为阳性,-1为阴性)。数据仅含一个文件BRCA.expr.HER2.txt,适用于以基因表达特征进行HER2状态分类的机器学习练习(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2015-01-28。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我访问了该出版物中使用的数据( = 阳性,-1 = 阴性)。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 37.46 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.1294983.v3。
【主题与分类】
源站学科分类:Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。主题标签:breast cancer、gene expression microarray、Machine learning、her2、Bioinformatics。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Breast_cancer_data_from_TCGA_for_machine_learning_exercise/1294983
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Piccolo, Stephen (2015). Breast cancer data from TCGA for machine learning exercise. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2016-01-19,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Breast cancer data from TCGA for machine learning exercise
- DOI:10.6084/m9.figshare.1294983.v3
- 发布日期:2015-01-28
- 文件数:1 个
- 文件总体积:37.46 MB
- 源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Breast_cancer_data_from_TCGA_for_machine_learning_exercise/1294983
命令行下载
curl -L -o "BRCA.expr.HER2.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/1874300"
文件清单
BRCA.expr.HER2.txt(37.46 MB)
文件总体积 37.46 MB(源站 API 实测)。
数据说明
我访问了本出版物中使用的数据(https://tcga-data.nci.nih.gov/docs/publications/brca_2012/),并解析了临床数据以确定哪些患者为HER2阳性。随后,我提取了这些患者的基因表达数据,并创建了一个矩阵,用以表示所有无缺失值基因的表达水平。第一行表示HER2状态(1 = 阳性,-1 = 阴性)。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.1294983.v3(source: https://figshare.com/articles/dataset/Breast_cancer_data_from_TCGA_for_machine_learning_exercise/1294983)。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




